RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461653.5

RABGGTB-204, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 5

Gene RABGGTB, Length 1,702 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-204ENST00000461653 LRP8Q14114 963 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 IKBKEQ14164 716 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ECM1Q16610 540 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 HGSNATQ68CP4 663 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 VN1R5Q7Z5H4 357 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 ARMC10Q8N2F6 343 aa8.18□□□□□ -1.1
RABGGTB-204ENST00000461653 DHX15O43143 795 aaKnown RBP8.17□□□□□ -1.1
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RABGGTB-204ENST00000461653 RUSC1Q9BVN2 902 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGGTB-204ENST00000461653 STOML1Q9UBI4 398 aa8.16□□□□□ -1.1
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RABGGTB-204ENST00000461653 SART1O43290 800 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 IGLV1-40P01703 118 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 NEFLP07196 543 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 PREPP48147 710 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 PDE3BQ13370 1112 aa8.13□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 FDX2Q6P4F2 183 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 USP26Q9BXU7 913 aa8.13□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RABGGTB-204ENST00000461653 C7orf69Q9H7B7 122 aa8.12□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 MEGF11A6BM72 1044 aa8.11□□□□□ -1.11
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RABGGTB-204ENST00000461653 PCMTD2Q9NV79 361 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 SOWAHDA6NJG2 315 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 TIAF1O95411 115 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 DNAJC25Q9H1X3 360 aa8.06□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 MAP4P27816 1152 aaKnown RBP8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 CD97P48960 835 aa8.05□□□□□ -1.12
RABGGTB-204ENST00000461653 SGO2Q562F6 1265 aa8.05□□□□□ -1.12
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