RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM266Q2M3C6 531 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 LRRC43Q8N309 656 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 USP19O94966 1318 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF280CQ8ND82 737 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 A0A087WZG4 1122 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RIOK3O14730 519 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF287Q9HBT7 754 aa13.13□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 F8W031 263 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SYCP3Q8IZU3 236 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TTC41PQ6P2S7 1318 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MAP3K12Q12852 859 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 BIRC2Q13490 618 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 BICD1Q96G01 975 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 PRDM16Q9HAZ2 1276 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC194A0A1B0GVG4 234 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CREB3L3Q68CJ9 461 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ATP2C2O75185 946 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZUG5 572 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 GET4Q7L5D6 327 aaPredicted RBP13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC40Q4G0X9 1142 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RUFY3Q7L099 469 aa13.12□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 NOP2P46087 812 aaKnown RBP13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CHAMP1Q96JM3 812 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 OGFRQ9NZT2 677 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 STAMBPO95630 424 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 LMAN1P49257 510 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 PRKG1Q13976 671 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 GPT2Q8TD30 523 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TSC1Q92574 1164 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TRIM6Q9C030 488 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MYO1BO43795 1136 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 HOOK3Q86VS8 718 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 IDEP14735 1019 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 UBASH3AP57075 661 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 FLCNQ8NFG4 579 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RIMS2Q9UQ26 1411 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SMYD5Q6GMV2 418 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 GBP7Q8N8V2 638 aaPredicted RBP13.11□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 FAM173BQ6P4H8 233 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CATIPQ7Z7H3 387 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 C10orf67Q8IYJ2 551 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 IQCA1Q86XH1 822 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 FEZ2Q9UHY8 353 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 DTNBO60941 627 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 IL13P35225 146 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 DPH6Q7L8W6 267 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MAATS1Q7Z4T9 603 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SNX14Q9Y5W7 946 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MBD5Q9P267 1494 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ABCC4O15439 1325 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CCDC102BQ68D86 513 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CFAP57Q96MR6 1250 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MAP9Q49MG5 647 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RABGAP1Q9Y3P9 1069 aa13.1□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 CNGA1P29973 690 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 GJC1P36383 396 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SYKP43405 635 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM67Q5HYA8 995 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 VPS36Q86VN1 386 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MICU3Q86XE3 530 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SLC26A6Q9BXS9 759 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 NPATQ14207 1427 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 KCNG4Q8TDN1 519 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MYZAPP0CAP1 466 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 DEUP1Q05D60 604 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 VTI1AQ96AJ9 217 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ABCC10Q5T3U5 1492 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 WDR7Q9Y4E6 1490 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 TMEM110-MUSTN1A8MSY1 372 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 RNF8O76064 485 aa13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 ARL1P40616 181 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 YEATS4O95619 227 aa13.08□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SPECC1Q5M775 1068 aa13.08□□□□□ -0.31
CCBE1-202ENST00000439986 SGSM2O43147 1006 aa13.08□□□□□ -0.32
CCBE1-202ENST00000439986 ALDH1L1O75891 902 aa13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms