RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 CCNJLQ8IV13 435 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 KLHDC7BQ96G42 594 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 KCNK4Q9NYG8 393 aa7.15□□□□□ -1.26
RBM39-210ENST00000425184 METTL12A8MUP2 240 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 WISP1O95388 367 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 H2AFB1P0C5Y9 115 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 H2AFB2P0C5Z0 115 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 KIAA0319Q5VV43 1072 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 AGGF1Q8N302 714 aaeCLIP7.14□□□□□ -1.274e-21■□□□□ 8
RBM39-210ENST00000425184 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 CCDC74AQ96AQ1 378 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 MEGF10Q96KG7 1140 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 CSRNP1Q96S65 589 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 NPHS2Q9NP85 383 aa7.14□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 A0A096LPE4 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 A0A1W2PPZ6 126 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 DYRK3O43781 588 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 ADAM11O75078 769 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 GLB1P16278 677 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 NLRP12P59046 1061 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 Q6ZS46 218 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 TCF12Q99081 682 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 EHD4Q9H223 541 aa7.13□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 ESRRAP11474 423 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 UBASH3BQ8TF42 649 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 CEP41Q9BYV8 373 aa7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 SOX17Q9H6I2 414 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 NISCHQ9Y2I1 1504 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 TREHO43280 583 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 GRIA4P48058 902 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 PLCB3Q01970 1234 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 SPRED3Q2MJR0 410 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 HGSNATQ68CP4 663 aa7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 ZSCAN29Q8IWY8 852 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 CLEC4MQ9H2X3 399 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 PCDH1Q08174 1060 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 DSC3Q14574 896 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 RNF208Q9H0X6 261 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.1□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 ITGB7P26010 798 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 GSTM4Q03013 218 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 RUSC1Q9BVN2 902 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 USP26Q9BXU7 913 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 NLRP2Q9NX02 1062 aa7.09□□□□□ -1.27
RBM39-210ENST00000425184 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 UVSSAQ2YD98 709 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 PRSS36Q5K4E3 855 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ANKRD34AQ69YU3 496 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 PRR23CQ6ZRP0 262 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 AEBP1Q8IUX7 1158 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 UBL7Q96S82 380 aaPredicted RBP7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ZNF576Q9H609 170 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ITPKAP23677 461 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 GRM2Q14416 872 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ZNF423Q2M1K9 1284 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 FDX2Q6P4F2 183 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 UTP4Q969X6 686 aaKnown RBP7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ASB16Q96NS5 453 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ABCB6Q9NP58 842 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.07□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 LOC100289279A0A1B0GTE1 492 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 MEGF11A6BM72 1044 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 SART1O43290 800 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 B3GALT4O96024 378 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 NUTM2GQ5VZR2 741 aa7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 FAM46AQ96IP4 442 aaKnown RBP7.06□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 DHX15O43143 795 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 CYP11A1P05108 521 aa7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 MAPK8P45983 427 aa7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 RPS26P11Q5JNZ5 115 aaPredicted RBP7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ZFYVE1Q9HBF4 777 aa7.05□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 HP1BP3Q5SSJ5 553 aaPredicted RBP7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 PI16Q6UXB8 463 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 ARMC10Q8N2F6 343 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 GLIS3Q8NEA6 775 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 FBF1Q8TES7 1133 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 MYRFLQ96LU7 910 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 BCO2Q9BYV7 579 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 NRSN2Q9GZP1 204 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 CYP4F12Q9HCS2 524 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 RAXQ9Y2V3 346 aa7.04□□□□□ -1.28
RBM39-210ENST00000425184 DLGAP3O95886 979 aa7.03□□□□□ -1.28
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