RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420768.1

TOP3BP1-201, Transcript of DNA topoisomerase III beta pseudogene 1, humanhuman

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Gene TOP3BP1, Length 1,380 nt, Biotype processed pseudogene.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3BP1-201ENST00000420768 PODNQ7Z5L7 613 aa20.53■□□□□ 0.88
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TOP3BP1-201ENST00000420768 LTBP3Q9NS15 1303 aa20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 IGSF3O75054 1194 aa20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 WDR66Q8TBY9 1149 aa20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 TAOK3Q9H2K8 898 aa20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 ANTXR1Q9H6X2 564 aa20.52■□□□□ 0.88
TOP3BP1-201ENST00000420768 PPIP5K2O43314 1243 aa20.51■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 AOC3Q16853 763 aa20.51■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 TBC1D9Q6ZT07 1266 aa20.51■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP20.51■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa20.5■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 SALL1Q9NSC2 1324 aa20.5■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa20.49■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM205AQ6ZU69 1335 aa20.49■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 MAP3K12Q12852 859 aa20.48■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 TMED8Q6PL24 325 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 LARGE2Q8N3Y3 721 aa20.48■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RUFY2Q8WXA3 655 aa20.47■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 DBNDD1Q9H9R9 158 aa20.47■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
TOP3BP1-201ENST00000420768 ABCF2Q9UG63 623 aa20.46■□□□□ 0.87
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TOP3BP1-201ENST00000420768 TTLL5Q6EMB2 1281 aa20.45■□□□□ 0.86
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAD50Q92878 1312 aa20.44■□□□□ 0.86
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TOP3BP1-201ENST00000420768 RAI14Q9P0K7 980 aa20.44■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L3A6NCW0 530 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L4A6NCW7 530 aa20.43■□□□□ 0.86
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TOP3BP1-201ENST00000420768 PDE6AP16499 860 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 USP17L1Q7RTZ2 530 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNRF3Q9ULT6 936 aa20.43■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 SGSM2O43147 1006 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 APPBP2Q92624 585 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 FAM227BQ96M60 508 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 JAG2Q9Y219 1238 aa20.42■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 YDJCA8MPS7 323 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 REC8O95072 547 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 PRDX5P30044 214 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 RASSF7Q02833 373 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAGEB6Q8N7X4 407 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 FBXW7Q969H0 707 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ZNF532Q9HCE3 1301 aa20.41■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 A0A0D9SFI3 127 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 TCRBV5S4A2TA0A5A2 114 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 GSTO1P78417 241 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 MECOMQ03112 1051 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 DACT2Q5SW24 774 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 NSUN4Q96CB9 384 aaKnown RBP20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 AKAP11Q9UKA4 1901 aa20.4■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20.39■□□□□ 0.86
TOP3BP1-201ENST00000420768 LMNB1P20700 586 aa20.39■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 SLF2Q8IX21 1173 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 OSBP2Q969R2 916 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 UPF2Q9HAU5 1272 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 KCNQ5Q9NR82 932 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 MAST3O60307 1309 aa20.38■□□□□ 0.85
TOP3BP1-201ENST00000420768 MYO3BQ8WXR4 1341 aa20.38■□□□□ 0.85
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