RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420504.2

TMEM200B-201, Transcript of transmembrane protein 200B, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TMEM200B, Length 2,553 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 MYH7P12883 1935 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1W2PQ27 194 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1W2PQ64 194 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1W2PQD8 194 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ADORA1P30542 326 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ERCC4Q92889 916 aaPredicted RBP25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 CTNNA3Q9UI47 895 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ERVV-2B6SEH9 535 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 NEMFO60524 1076 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 LINC00301Q8NCQ3 95 aa25.23■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 STRCP1A6NGW2 1772 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 HAND2P61296 217 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 OTUD7BQ6GQQ9 843 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP57L1Q8IYX8 460 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 HPS5Q9UPZ3 1129 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ISCA1Q9BUE6 129 aa25.22■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 NEDD4P46934 1319 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 FGAP02671 866 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ZCRB1Q8TBF4 217 aaKnown RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 XAGE2Q96GT9 111 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC158Q5M9N0 1113 aa25.21■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 A0A1B0GVL5 298 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 NDUFA8P51970 172 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 SCARF1Q14162 830 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 SYCP1Q15431 976 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 AOPEPQ8N6M6 819 aa25.2■■□□□ 1.63
TMEM200B-201ENST00000420504 PRC1O43663 620 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 TTC39AQ5SRH9 613 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3EQ9NVU0 708 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CLIC4Q9Y696 253 aa25.2■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 TNS2Q63HR2 1409 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 ANTXR2P58335 489 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 WASHC4Q2M389 1173 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC57Q2TAC2 916 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 C8orf76Q96K31 380 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXO3Q9UK99 471 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SPDYE4A6NLX3 237 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 USP27XA6NNY8 438 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CCZ1BP86790 482 aa25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CCZ1P86791 482 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SKILP12757 684 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SDF4Q9BRK5 362 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NAT10Q9H0A0 1025 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 AKAP2Q9Y2D5 859 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 C4AP0C0L4 1744 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 C4BP0C0L5 1744 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC69A6NI79 296 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 YEATS4O95619 227 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 KCNG4Q8TDN1 519 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 APPBP2Q92624 585 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR17Q8IZU2 1322 aa25.18■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 GOLGA8BA8MQT2 603 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 STK38Q15208 465 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 GORABQ5T7V8 394 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NYAP1Q6ZVC0 841 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SHANK3Q9BYB0 1731 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 DHX16O60231 1041 aaKnown RBP25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 TCIRG1Q13488 830 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 MYSM1Q5VVJ2 828 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 KIAA1468Q9P260 1216 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 AKAP11Q9UKA4 1901 aa25.17■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 ZAP70P43403 619 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NBPF11Q86T75 865 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CCDC112Q8NEF3 446 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 GJB4Q9NTQ9 266 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 ABCC12Q96J65 1359 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 DPCR1Q3MIW9 517 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 CEP135Q66GS9 1140 aa25.16■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 BRAPQ7Z569 592 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 NCOA7Q8NI08 942 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 FBXW7Q969H0 707 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SPTLC2O15270 562 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 PI16Q6UXB8 463 aa25.15■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 KIF28PB7ZC32 967 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 BPIFA3Q9BQP9 254 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 WDR19Q8NEZ3 1342 aa25.14■■□□□ 1.62
TMEM200B-201ENST00000420504 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
TMEM200B-201ENST00000420504 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa25.14■■□□□ 1.61
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