RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000420138.5

GPC1-202, Transcript of glypican 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene GPC1, Length 1,835 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1-202ENST00000420138 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP25.1■■□□□ 1.61
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GPC1-202ENST00000420138 RNF20Q5VTR2 975 aa25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 TMX3Q96JJ7 454 aa25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 FOXD4L1Q9NU39 408 aa25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 PDE6AP16499 860 aa25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 DEKP35659 375 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 CYP21A2P08686 494 aa25.08■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP25.08■■□□□ 1.61
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GPC1-202ENST00000420138 CHMP5Q9NZZ3 219 aa25.08■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP25.08■■□□□ 1.61
GPC1-202ENST00000420138 ZNF532Q9HCE3 1301 aa25.08■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 CAVIN4Q5BKX8 364 aa25.07■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 AK2P54819 239 aa25.06■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 CUL4AQ13619 759 aa25.06■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 RUFY3Q7L099 469 aa25.06■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 TXNRD3Q86VQ6 643 aa25.06■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 BRIP1Q9BX63 1249 aa25.06■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 DOCK2Q92608 1830 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 GPAA1O43292 621 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.05■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 A0A0G2JLW4 131 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 CRAMP1Q96RY5 1269 aa25.05■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa25.05■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 MAP3K12Q12852 859 aa25.04■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 LEMD3Q9Y2U8 911 aa25.04■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 MYH7P12883 1935 aa25.03■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 PSMA5P28066 241 aa25.03■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 XDHP47989 1333 aa25.03■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 SEMA3EO15041 775 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 BBOX1O75936 387 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 STOX1Q6ZVD7 989 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 MAGEB6Q8N7X4 407 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 PDRG1Q9NUG6 133 aa25.02■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 GPSM2P81274 684 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 KRT32Q14532 448 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 TTLL5Q6EMB2 1281 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 VPS37DQ86XT2 251 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 SLC16A10Q8TF71 515 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa25.02■■□□□ 1.6
GPC1-202ENST00000420138 DENND2AQ9ULE3 1009 aa25.02■■□□□ 1.6
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GPC1-202ENST00000420138 CACNA1SQ13698 1873 aa25■■□□□ 1.59
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GPC1-202ENST00000420138 LRP2BPQ9P2M1 347 aa24.98■■□□□ 1.59
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GPC1-202ENST00000420138 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.98■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 ZNF384Q8TF68 577 aa24.97■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 TCEANC2Q96MN5 208 aa24.97■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP24.97■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
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GPC1-202ENST00000420138 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP24.97■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 LARGE1O95461 756 aa24.96■■□□□ 1.59
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GPC1-202ENST00000420138 CTNNA3Q9UI47 895 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 E7EWF7 191 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 NPR1P16066 1061 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 AIDAQ96BJ3 306 aa24.96■■□□□ 1.59
GPC1-202ENST00000420138 MBD4O95243 580 aa24.95■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 ATP2B4P23634 1241 aa24.95■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 TMC4Q7Z404 712 aa24.95■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 LRRC37AA6NMS7 1700 aa24.94■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP24.94■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 SP8Q8IXZ3 490 aa24.94■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 ARMT1Q9H993 441 aa24.94■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 RAI14Q9P0K7 980 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 POLLQ9UGP5 575 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 TPCN1Q9ULQ1 816 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 LTBP1Q14766 1721 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 UFL1O94874 794 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 ST3GAL1Q11201 340 aa24.93■■□□□ 1.58
GPC1-202ENST00000420138 LCORLQ8N3X6 602 aa24.93■■□□□ 1.58
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