RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000399451.6

ANKRD28-201, Transcript of ankyrin repeat domain 28, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ANKRD28, Length 6,564 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD28-201ENST00000399451 IVLP07476 585 aa24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 OPA1O60313 960 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 HSPA2P54652 639 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 GNAT2P19087 354 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT2P35908 639 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 CEP63Q96MT8 703 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 RLBP1P12271 317 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PRPHP41219 470 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TCHPQ9BT92 498 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PIK3C2GO75747 1445 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 VAMP4O75379 141 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 PTGS1P23219 599 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 LRRC45Q96CN5 670 aa24.27■■□□□ 1.48
ANKRD28-201ENST00000399451 TNNI2P48788 182 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 APOBRQ0VD83 1088 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 C6orf50Q9HD87 102 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 RAD50Q92878 1312 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 STK32BQ9NY57 414 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 A0A1W2PRG0 241 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 C6orf163Q5TEZ5 329 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PLCG2P16885 1265 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MCM6Q14566 821 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 RIMS2Q9UQ26 1411 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 SPDYE3A6NKU9 549 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 BRAPQ7Z569 592 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 FAM212AQ96EL1 285 aa24.26■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PTPDC1A2A3K4 754 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 GNPATO15228 680 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 POLKQ9UBT6 870 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PTPRKQ15262 1439 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 LINS1Q8NG48 757 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ZFYVE9O95405 1425 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 KRT86O43790 486 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa24.25■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 CHMLP26374 656 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 USP26Q9BXU7 913 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 BICDL2A1A5D9 508 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ZFP91Q96JP5 570 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ANKRD2Q9GZV1 360 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 CALML3P27482 149 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 TSPYL6Q8N831 410 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 HSPA4P34932 840 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 LMBR1Q8WVP7 490 aa24.24■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 DPH6Q7L8W6 267 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MCM9Q9NXL9 1143 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 TUBB4BP68371 445 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF5AQ12840 1032 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MAP3K5Q99683 1374 aa24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 LDHBP07195 334 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 TAF12Q16514 161 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 CHST3Q7LGC8 479 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 IMPG2Q9BZV3 1241 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 UBXN1Q04323 297 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 RGS22Q8NE09 1264 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PPP1R14CQ8TAE6 165 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PODXL2Q9NZ53 605 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 JAG2Q9Y219 1238 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 FLT4P35916 1363 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ZNF408Q9H9D4 720 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MRVI1Q9Y6F6 885 aa24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ATP2C2O75185 946 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 TFCP2Q12800 502 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MAGEB6Q8N7X4 407 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 PPM1EQ8WY54 764 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 C19orf44Q9H6X5 657 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 IFNKQ9P0W0 207 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 STMN4Q9H169 189 aaPredicted RBP24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 RSPH14Q9UHP6 348 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 MIGA1Q8NAN2 632 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 ABCC1P33527 1531 aa24.21■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 BTG4Q9NY30 223 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 V9GYY5 206 aaPredicted RBP24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 SBNO2Q9Y2G9 1366 aa24.2■■□□□ 1.47
ANKRD28-201ENST00000399451 KIF4AO95239 1232 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC42Q96M95 316 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 FERP16591 822 aa24.2■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 ATL3Q6DD88 541 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PUS7Q96PZ0 661 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 KARSQ15046 597 aaKnown RBP24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa24.19■■□□□ 1.46
ANKRD28-201ENST00000399451 SP4Q02446 784 aa24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms