RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368460.7

PBXIP1-201, Transcript of PBX homeobox interacting protein 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 3 BASIC

Gene PBXIP1, Length 1,175 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBXIP1-201ENST00000368460 IFNL1Q8IU54 200 aa23.52■■□□□ 1.36
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PBXIP1-201ENST00000368460 EFCC1Q9HA90 598 aa23.43■■□□□ 1.34
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PBXIP1-201ENST00000368460 LDHAL6AQ6ZMR3 332 aa23.42■■□□□ 1.34
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PBXIP1-201ENST00000368460 SERPINA10Q9UK55 444 aa23.36■■□□□ 1.33
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PBXIP1-201ENST00000368460 PTPN18Q99952 460 aa23.34■■□□□ 1.33
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PBXIP1-201ENST00000368460 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
PBXIP1-201ENST00000368460 GTF2A2P52657 109 aa23.33■■□□□ 1.33
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PBXIP1-201ENST00000368460 CCDC184Q52MB2 194 aa23.33■■□□□ 1.33
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