RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366687.5

CCSAP-203, Transcript of centriole, cilia and spindle associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCSAP, Length 5,089 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSAP-203ENST00000366687 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.04■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 FAM107BQ9H098 131 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 SYT1P21579 422 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE15A4D2H0 777 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE8P0CG41 777 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 G2E3Q7L622 706 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE6Q86UF2 777 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE4Q8IX94 777 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.03■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 MAATS1Q7Z4T9 603 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 ZKSCAN5Q9Y2L8 839 aa23.02■■□□□ 1.28
CCSAP-203ENST00000366687 IL13P35225 146 aa23.02■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TNNI2P48788 182 aa23.02■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 IQUBQ8NA54 791 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CHL1O00533 1208 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TACC1O75410 805 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 KAT6BQ8WYB5 2073 aa23.01■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SBNO1A3KN83 1393 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 BICDL2A1A5D9 508 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 EYA3Q99504 573 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CALCOCO1Q9P1Z2 691 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 KRT83P78385 493 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 PARP10Q53GL7 1025 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TTC6Q86TZ1 520 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SH3TC1Q8TE82 1336 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 DTHD1Q6ZMT9 781 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 DHX37Q8IY37 1157 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 A0A1B0GUL7 405 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CLCN1P35523 988 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 PRPHP41219 470 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TIMM10P62072 90 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 HS2ST1Q7LGA3 356 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 DENND2AQ9ULE3 1009 aa23■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 FAM89AQ96GI7 184 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 ARFGAP3Q9NP61 516 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 DDX12PQ92771 950 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 MBD4O95243 580 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 PHACTR2O75167 634 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 KIF5AQ12840 1032 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 UBE4AQ14139 1066 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SELENOOQ9BVL4 669 aa22.99■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 EDC4Q6P2E9 1401 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CEP112Q8N8E3 955 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 KRT86O43790 486 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC42Q96M95 316 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 B4DLN1 442 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 PTGS1P23219 599 aa22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 MRPL12P52815 198 aaKnown RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TNNI3KQ59H18 835 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TMEM87BQ96K49 555 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 IMPG2Q9BZV3 1241 aa22.97■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 AOX1Q06278 1338 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 HS1BP3Q53T59 392 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 TCHPQ9BT92 498 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SEC24BO95487 1268 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 MCM7P33993 719 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SYNCQ9H7C4 482 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 STAMBPO95630 424 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 RILPL1Q5EBL4 403 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 SPECC1LQ69YQ0 1117 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 VEZTQ9HBM0 779 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 HOMER2Q9NSB8 354 aa22.96■■□□□ 1.27
CCSAP-203ENST00000366687 KIAA0556O60303 1618 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 HSF2BPO75031 334 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 RXRAP19793 462 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 LMBR1Q8WVP7 490 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 GTF2F1P35269 517 aaKnown RBP eCLIP22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 DBNDD2Q9BQY9 259 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 RPS6KB1P23443 525 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CCDC155Q8N6L0 562 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 APPBP2Q92624 585 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 DRC1Q96MC2 740 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 BTG4Q9NY30 223 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 IKBKGQ9Y6K9 419 aa22.95■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 ITGA6P23229 1130 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 STX17P56962 302 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 CTAGE9A4FU28 777 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 FAM13AO94988 1023 aa22.94■■□□□ 1.26
CCSAP-203ENST00000366687 JDP2Q8WYK2 163 aa22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms