RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000358923.10

PDE4D-204, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE4D, Length 2,969 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-204ENST00000358923 LPIN2Q92539 896 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 SPEF2Q9C093 1822 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ATRNO75882 1429 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 THSD7AQ9UPZ6 1657 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 CUL4AQ13619 759 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 NFIXQ14938 502 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa21.23■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 KIF20AO95235 890 aa21.22■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 FBXO3Q9UK99 471 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 SPATA5Q8NB90 893 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 KCNB2Q92953 911 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ABCF2Q9UG63 623 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF532Q9HCE3 1301 aa21.21■□□□□ 0.99
PDE4D-204ENST00000358923 GPAA1O43292 621 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 APPP05067 770 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 FOSBP53539 338 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 MROH5Q6ZUA9 1318 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 MIGA1Q8NAN2 632 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 GBP4Q96PP9 640 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SMIM22K7EJ46 135 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SLC5A1P13866 664 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RPS6KB1P23443 525 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RNF20Q5VTR2 975 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 TXNRD3Q86VQ6 643 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 IL17RAQ96F46 866 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 MINPP1Q9UNW1 487 aa21.2■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 FGAP02671 866 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 MAGEB6Q8N7X4 407 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NEK1Q96PY6 1258 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 Q6ZUG5 572 aa21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP21.19■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 HELLSQ9NRZ9 838 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 MCM2P49736 904 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 BRF1Q92994 677 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NLRP3Q96P20 1036 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 TMEM51Q9NW97 253 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 PRKAB2O43741 272 aa21.18■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 PDE6AP16499 860 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 HS1BP3Q53T59 392 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 LETM1O95202 739 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 GJB2P29033 226 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SASS6Q6UVJ0 657 aa21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.17■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 PTMSP20962 102 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 CDC5LQ99459 802 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 E7EWF7 191 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 JAK2O60674 1132 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 ADD2P35612 726 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 FAM173BQ6P4H8 233 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 ARMT1Q9H993 441 aa21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP21.16■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RPS8P62241 208 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 CCT2P78371 535 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NUCB2P80303 420 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 APOBRQ0VD83 1088 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 ADGRA1Q86SQ6 560 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 FERMT3Q86UX7 667 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 DDX11Q96FC9 970 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 APPBP2Q92624 585 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SMC3Q9UQE7 1217 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 KDM4AO75164 1064 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SYT1P21579 422 aa21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP21.15■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 RREB1Q92766 1687 aa21.14■□□□□ 0.98
PDE4D-204ENST00000358923 PSMA5P28066 241 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 TXNRD1Q16881 649 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 SBF2Q86WG5 1849 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 GYS1P13807 737 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 TM4SF1P30408 202 aa21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP21.14■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 MSL1Q68DK7 614 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 VPS37DQ86XT2 251 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 LRP2BPQ9P2M1 347 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 ZNF827Q17R98 1081 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 BRWD3Q6RI45 1802 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 NHSQ6T4R5 1651 aa21.13■□□□□ 0.97
PDE4D-204ENST00000358923 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP21.12■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms