RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356388.8

SPRED2-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 2, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED2, Length 4,097 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED2-201ENST00000356388 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CYP7A1P22680 504 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 TXLNAP40222 546 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 GOLGA6L1Q8N7Z2 621 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 TAF6LQ9Y6J9 622 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ERICH4A6NGS2 130 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CAVIN4Q5BKX8 364 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 DACH1Q9UI36 760 aa14.68□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 MBD4O95243 580 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ADD1P35611 737 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 IQCA1Q86XH1 822 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 GSDMDP57764 484 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 APPBP2Q92624 585 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 BTG4Q9NY30 223 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CYP27B1O15528 508 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 NCOA3Q9Y6Q9 1424 aa14.67□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CCP110O43303 1012 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 FGAP02671 866 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 DNAI1Q9UI46 699 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 SHPRHQ149N8 1683 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CDC42BPGQ6DT37 1551 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 NEMFO60524 1076 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 RTN1Q16799 776 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 SKIDA1Q1XH10 827 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 MRVI1Q9Y6F6 885 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ARMT1Q9H993 441 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 GJB4Q9NTQ9 266 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ATP6V1AP38606 617 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 TEX35Q5T0J7 233 aa14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CMTR1Q8N1G2 835 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ADGRB2O60241 1585 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 hCG_1642624A0A1W2PR95 340 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 PRDM1O75626 825 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 STX17P56962 302 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 MTX1Q13505 466 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 MYRIPQ8NFW9 859 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 SMARCE1Q969G3 411 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 CTDSPL2Q05D32 466 aa14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 ANGEL1Q9UNK9 670 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
SPRED2-201ENST00000356388 NLRP5P59047 1200 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ANO1Q5XXA6 986 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ASAP1Q9ULH1 1129 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CEP131Q9UPN4 1083 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 GPS2Q13227 327 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CATIPQ7Z7H3 387 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 DSCC1Q9BVC3 393 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ZNF202O95125 648 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 TCIRG1Q13488 830 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 SYT10Q6XYQ8 523 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 MKNK2Q9HBH9 465 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PAXBP1Q9Y5B6 917 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PREX1Q8TCU6 1659 aa14.64□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PFKFB2O60825 505 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 USP5P45974 858 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 GNG11P61952 73 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 NSUN7Q8NE18 718 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 DHX58Q96C10 678 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PDLIM2Q96JY6 352 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 MAST3O60307 1309 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 OSBP2Q969R2 916 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 DLC1Q96QB1 1528 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 KCNJ14Q9UNX9 436 aa14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 TSPY2A6NKD2 308 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PTPN21Q16825 1174 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 DZIP1Q86YF9 867 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 SYNE4Q8N205 404 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CCDC24Q8N4L8 307 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CAGE1Q8TC20 777 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 MAGEC2Q9UBF1 373 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PCDHA7Q9UN72 937 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 PTPRUQ92729 1446 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 BRAPQ7Z569 592 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 NOC3LQ8WTT2 800 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 POLR3GO15318 223 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 SSBP05455 408 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 CCDC152Q4G0S7 254 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 KRT40Q6A162 431 aa14.62□□□□□ -0.07
SPRED2-201ENST00000356388 ZNF652Q9Y2D9 606 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.8 ms