RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000355765.10

PRPF39-201, Transcript of pre-mRNA processing factor 39, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRPF39, Length 2,868 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF39-201ENST00000355765 TAOK2Q9UL54 1235 aa21.85■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 ROBO2Q9HCK4 1378 aa21.85■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 JCADQ9P266 1359 aa21.85■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 PSME1Q06323 249 aa21.85■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 EFCC1Q9HA90 598 aa21.85■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa21.84■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 LONRF2Q1L5Z9 754 aa21.84■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 A0A0G2JLW4 131 aa21.84■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF202O95125 648 aa21.84■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 NALCNQ8IZF0 1738 aa21.83■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 PLEKHG3A1L390 1219 aa21.83■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 LINC00301Q8NCQ3 95 aa21.83■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 VPS18Q9P253 973 aa21.83■■□□□ 1.09
PRPF39-201ENST00000355765 MCM6Q14566 821 aa21.83■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 FOXR1Q6PIV2 292 aa21.83■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 EXOC4Q96A65 974 aa21.83■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ZSCAN12O43309 604 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 TOP1P11387 765 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MAP3K9P80192 1104 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PDILTQ8N807 584 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DHX58Q96C10 678 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MRFAP1Q9Y605 127 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 U3KPZ7 1027 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ZNF609O15014 1411 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 GJB4Q9NTQ9 266 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 RTEL1Q9NZ71 1219 aa21.82■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ACTN2P35609 894 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 KARSQ15046 597 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 CHMP4CQ96CF2 233 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PDE11AQ9HCR9 933 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 BABAM1Q9NWV8 329 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ATL3Q6DD88 541 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MPHOSPH8Q99549 860 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PQ27 194 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PQ64 194 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 A0A1W2PQD8 194 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 TOGARAM2Q6ZUX3 1019 aa21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DESI2Q9BSY9 194 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 CARMIL3Q8ND23 1372 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ANKRD65E5RJM6 399 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 SPTLC2O15270 562 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 TMEM139Q8IV31 216 aa21.8■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 GRM8O00222 908 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PFKFB1P16118 471 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 HOXC9P31274 260 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DHX8Q14562 1220 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 LEKR1Q6ZMV7 388 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 VSTM4Q8IW00 320 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 GOLGA1Q92805 767 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 EID1Q9Y6B2 187 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 N4BP1O75113 896 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 FDPSP14324 419 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 NLRP6P59044 892 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 RABGGTAQ92696 567 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 IRX2Q9BZI1 471 aaPredicted RBP21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ABCC6O95255 1503 aa21.79■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DBNLQ9UJU6 430 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 SALL1Q9NSC2 1324 aa21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 WWC2Q6AWC2 1192 aa21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 SUGCTQ9HAC7 445 aa21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa21.78■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ARHGAP6O43182 974 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ADKP55263 362 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 KSR2Q6VAB6 950 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 KIFC2Q96AC6 838 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 FANCLQ9NW38 375 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa21.77■■□□□ 1.08
PRPF39-201ENST00000355765 BTBD11A6QL63 1104 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 IKBKBO14920 756 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 CBFA2T2O43439 604 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 TXLNAP40222 546 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 MYL5Q02045 173 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF6Q5VWK0 638 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 KCNG4Q8TDN1 519 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 NBPF4Q96M43 638 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 PSD3Q9NYI0 1048 aa21.77■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 INTS13Q9NVM9 706 aa21.76■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 PNOCQ13519 176 aa21.76■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 TOMM22Q9NS69 142 aa21.75■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 FAN1Q9Y2M0 1017 aa21.75■■□□□ 1.07
PRPF39-201ENST00000355765 CCDC151A5D8V7 595 aa21.74■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19 ms