RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345716.8

NISCH-201, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 5,238 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-201ENST00000345716 CEP135Q66GS9 1140 aa23.72■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 DHX58Q96C10 678 aa23.71■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 LRRC27Q9C0I9 530 aa23.71■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
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NISCH-201ENST00000345716 PRIMPOLQ96LW4 560 aa23.69■■□□□ 1.38
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NISCH-201ENST00000345716 FAM173BQ6P4H8 233 aa23.67■■□□□ 1.38
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NISCH-201ENST00000345716 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP23.66■■□□□ 1.38
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NISCH-201ENST00000345716 ERVV-2B6SEH9 535 aa23.65■■□□□ 1.38
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NISCH-201ENST00000345716 TAF5LO75529 589 aa23.63■■□□□ 1.37
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NISCH-201ENST00000345716 CCDC87Q9NVE4 849 aa23.63■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 DYNC1I1O14576 645 aa23.63■■□□□ 1.37
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NISCH-201ENST00000345716 ZAP70P43403 619 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 MCM7P33993 719 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TAX1BP1Q86VP1 789 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TCIRG1Q13488 830 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TAF3Q5VWG9 929 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 PRR36Q9H6K5 1346 aa23.61■■□□□ 1.37
NISCH-201ENST00000345716 TM6SF1Q9BZW5 370 aa23.61■■□□□ 1.37
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