RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 XAGE2Q96GT9 111 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 AGXT2Q9BYV1 514 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 GPR108Q9NPR9 543 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PRDM11Q9NQV5 511 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 STRN4Q9NRL3 753 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CLIC4Q9Y696 253 aa8.52□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 GOLGA8BA8MQT2 603 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PRC1O43663 620 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 KINO60870 393 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 RXRAP19793 462 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 GPTP24298 496 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ANTXR2P58335 489 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 NAA30Q147X3 362 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC57Q2TAC2 916 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 AOPEPQ8N6M6 819 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC191Q8NCU4 936 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ENGASEQ8NFI3 743 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PCDHA7Q9UN72 937 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 KIF28PB7ZC32 967 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 BIN1O00499 593 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 FGAP02671 866 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 NDUFA8P51970 172 aa8.51□□□□□ -1.05
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PTPRR-202ENST00000342084 TAF7LQ5H9L4 462 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF592Q92610 1267 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 AIFM3Q96NN9 605 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 HPS5Q9UPZ3 1129 aa8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP8.51□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 UBR2Q8IWV8 1755 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CPDO75976 1380 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 WDR17Q8IZU2 1322 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 SPDYE4A6NLX3 237 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CIAO1O76071 339 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 TNNT1P13805 278 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CBX1P83916 185 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 FAM160A1Q05DH4 1040 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ATP2B3Q16720 1220 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC158Q5M9N0 1113 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ISM2Q6H9L7 571 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC94Q9BW85 323 aaPredicted RBP8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 RIC1Q4ADV7 1423 aa8.5□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 BECN2A8MW95 431 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 GPAA1O43292 621 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 STK38Q15208 465 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRR-202ENST00000342084 CADPS2Q86UW7 1296 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 LRRC8AQ8IWT6 810 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 DNAJC10Q8IXB1 793 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 C8orf76Q96K31 380 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 NBPF3Q9H094 633 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 SENP2Q9HC62 589 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CCDC69A6NI79 296 aa8.49□□□□□ -1.05
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PTPRR-202ENST00000342084 HLFQ16534 295 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 IMMTQ16891 758 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 DPCR1Q3MIW9 517 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MTERF4Q7Z6M4 381 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 SDF4Q9BRK5 362 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 INCENPQ9NQS7 918 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 TRMT1Q9NXH9 659 aaKnown RBP8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ASAP1Q9ULH1 1129 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PAPPAQ13219 1627 aa8.49□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 STRCQ7RTU9 1775 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MROH7-TTC4A0A0A0MT08 1334 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 ERVV-2B6SEH9 535 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 UBE2Q2LH0YL09 131 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CTAGE5O15320 804 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CDC25BP30305 580 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 MCAMP43121 646 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 TCIRG1Q13488 830 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 METTL24Q5JXM2 366 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 BRINP3Q76B58 766 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 CYB5R4Q7L1T6 521 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 TBC1D10CQ8IV04 446 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PDCL2Q8N4E4 241 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 APPBP2Q92624 585 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 PKNOX2Q96KN3 472 aa8.48□□□□□ -1.05
PTPRR-202ENST00000342084 GREM2Q9H772 168 aa8.48□□□□□ -1.05
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