RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335007.9

PPP1CC-201, Transcript of protein phosphatase 1 catalytic subunit gamma, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PPP1CC, Length 2,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPP1CC-201ENST00000335007 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 HAUS7Q99871 368 aa23.43■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 SPTLC2O15270 562 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ZNF202O95125 648 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ABTB2Q8N961 1025 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 SMARCE1Q969G3 411 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 CLIC4Q9Y696 253 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 KRBA2Q6ZNG9 492 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 DSCC1Q9BVC3 393 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 COPRSQ9NQ92 184 aa23.42■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 UBASH3AP57075 661 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 MPRIPQ6WCQ1 1025 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 TRIM34Q9BYJ4 488 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA6L9A6NEM1 432 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 FANCGO15287 622 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 SASH3O75995 380 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ST5P78524 1137 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF6Q5VWK0 638 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 NBPF4Q96M43 638 aa23.41■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 SERPINC1P01008 464 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 IP6K1Q92551 441 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 AMOTL2Q9Y2J4 779 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 CHGBP05060 677 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 IGKV5-2P06315 115 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 BRAPQ7Z569 592 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ARFGAP3Q9NP61 516 aa23.4■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ARHGAP6O43182 974 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 MYO1BO43795 1136 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 ATP1A3P13637 1013 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 CASQ1P31415 396 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 NEXNQ0ZGT2 675 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 TFCP2Q12800 502 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 KBTBD3Q8NAB2 608 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 AK7Q96M32 723 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 HELLSQ9NRZ9 838 aa23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.34
PPP1CC-201ENST00000335007 PALLDQ8WX93 1383 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 VWA3AA6NCI4 1184 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 E7EWF7 191 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 FDPSP14324 419 aaKnown RBP23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 LTKP29376 864 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 VSTM4Q8IW00 320 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 HSD3B7Q9H2F3 369 aa23.39■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 TOP1P11387 765 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 MYL5Q02045 173 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 CFAP100Q494V2 611 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 SLC26A8Q96RN1 970 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PPFIA3O75145 1194 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PFKFB1P16118 471 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 CMA1P23946 247 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 MAP3K9P80192 1104 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 C8orf76Q96K31 380 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP2R2CQ9Y2T4 447 aa23.38■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 NEURL1BA8MQ27 555 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 ZSCAN26Q16670 478 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 MYSM1Q5VVJ2 828 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RGPD2P0DJD1 1756 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PPP2R3AQ06190 1150 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 C1orf141Q5JVX7 400 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 MRFAP1Q9Y605 127 aa23.37■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 GCKRQ14397 625 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 AMOTQ4VCS5 1084 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 EPHA10Q5JZY3 1008 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 JAKMIP3Q5VZ66 844 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RSRC2Q7L4I2 434 aaKnown RBP23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RABGGTAQ92696 567 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 DPF2Q92785 391 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 DBNDD2Q9BQY9 259 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PSD3Q9NYI0 1048 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 TUBE1Q9UJT0 475 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 CCDC34Q96HJ3 373 aa23.36■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 FBXL16Q8N461 479 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 EXOC4Q96A65 974 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RASSF4Q9H2L5 321 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 TICAM2Q86XR7 235 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 TMEM139Q8IV31 216 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA5Q8TBA6 731 aa23.35■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 AXDND1Q5T1B0 1012 aaPredicted RBP23.34■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 ANO1Q5XXA6 986 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 GOLGA1Q92805 767 aa23.34■■□□□ 1.33
PPP1CC-201ENST00000335007 GNG11P61952 73 aa23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 46.1 ms