RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000313863.10

MKS1-201, Transcript of Meckel syndrome, type 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene MKS1, Length 2,091 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MKS1-201ENST00000313863 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
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MKS1-201ENST00000313863 USP27XA6NNY8 438 aa16.09■□□□□ 0.17
MKS1-201ENST00000313863 CIAO1O76071 339 aa16.09■□□□□ 0.17
MKS1-201ENST00000313863 SLC3A2P08195 630 aaKnown RBP16.09■□□□□ 0.17
MKS1-201ENST00000313863 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP16.09■□□□□ 0.17
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MKS1-201ENST00000313863 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP16.08■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 NUP188Q5SRE5 1749 aa16.08■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 ZNF202O95125 648 aa16.04■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 TIMM10P62072 90 aa16.04■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 PPP1R13BQ96KQ4 1090 aa16.04■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 NWD2Q9ULI1 1742 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 A0A1B0GUL7 405 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 GOLGA8BA8MQT2 603 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 PRC1O43663 620 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 CCDC191Q8NCU4 936 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 CEP126Q9P2H0 1117 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 CLIC4Q9Y696 253 aa16.04■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 COL18A1P39060 1754 aa16.04■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 CDKL5O76039 1030 aa16.03■□□□□ 0.16
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MKS1-201ENST00000313863 E4F1Q66K89 784 aaPredicted RBP16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 SRRTQ9BXP5 876 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 FAM53CQ9NYF3 392 aa16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 C4AP0C0L4 1744 aa16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 C4BP0C0L5 1744 aa16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 GORABQ5T7V8 394 aa16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 FBXW7Q969H0 707 aa16.03■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 PHLPP2Q6ZVD8 1323 aa16.02■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 GLI3P10071 1580 aa16.02■□□□□ 0.16
MKS1-201ENST00000313863 C1orf167Q5SNV9 1468 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 CSB-PGBD3P0DP91 1061 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 TTC39AQ5SRH9 613 aa16.02■□□□□ 0.15
MKS1-201ENST00000313863 ARMCX5Q6P1M9 558 aa16.02■□□□□ 0.15
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