RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000311008.15

SPNS1-201, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS1, Length 2,208 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-201ENST00000311008 GPTP24298 496 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 PUS7LQ9H0K6 701 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CBX8Q9HC52 389 aa22.92■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 MYH15Q9Y2K3 1946 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 AP5Z1O43299 807 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CHST3Q7LGC8 479 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 TRMT112Q9UI30 125 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ATRNO75882 1429 aa22.91■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 ADD2P35612 726 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 MCAMP43121 646 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC73Q6ZRK6 1079 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 VGLL2Q8N8G2 317 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 PDE8BO95263 885 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 UBE3CQ15386 1083 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 COL14A1Q05707 1796 aaKnown RBP22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 NWD2Q9ULI1 1742 aa22.9■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 MYH7P12883 1935 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 HAND2P61296 217 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 CCAR1Q8IX12 1150 aaKnown RBP22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 USP28Q96RU2 1077 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 SPTLC3Q9NUV7 552 aa22.89■■□□□ 1.26
SPNS1-201ENST00000311008 EXOC5O00471 708 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 TRDNQ13061 729 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 LUZP1Q86V48 1076 aa22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF830Q96NB3 372 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 MYH3P11055 1940 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 FDPSP14324 419 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF165P49910 485 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ARHGAP30Q7Z6I6 1101 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 SYNE4Q8N205 404 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 SLC4A9Q96Q91 983 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 RTEL1Q9NZ71 1219 aa22.88■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 MROH5Q6ZUA9 1318 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa22.87■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 GOLGA8BA8MQT2 603 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 KINO60870 393 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 FOSBP53539 338 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 FAM160A1Q05DH4 1040 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 PI16Q6UXB8 463 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 C8orf76Q96K31 380 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 PLCH1Q4KWH8 1693 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 CPLX1O14810 134 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 DNTTIP2Q5QJE6 756 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 BRAPQ7Z569 592 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 LPIN2Q92539 896 aa22.86■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 MPNDQ8N594 471 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 AKAP11Q9UKA4 1901 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 UQCRHLA0A096LP55 91 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 UQCRHP07919 91 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ME1P48163 572 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ANTXR2P58335 489 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 STX1AQ16623 288 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ILDR1Q86SU0 546 aaPredicted RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 PRIMPOLQ96LW4 560 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 HPS5Q9UPZ3 1129 aa22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 TNKS1BP1Q9C0C2 1729 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PQ27 194 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PQ64 194 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 A0A1W2PQD8 194 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 DYNC1I1O14576 645 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 CCDC102BQ68D86 513 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 GUCY1B3Q02153 619 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 SNW1Q13573 536 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ADALQ6DHV7 355 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 PLA2G4DQ86XP0 818 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 ENGASEQ8NFI3 743 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 KIAA1524Q8TCG1 905 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 KCNG4Q8TDN1 519 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 DNAJC25Q9H1X3 360 aa22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 YEATS4O95619 227 aa22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP22.83■■□□□ 1.25
SPNS1-201ENST00000311008 NUP98P52948 1817 aa22.83■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 IDH1O75874 414 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 CDKL5O76039 1030 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ZNF75DP51815 510 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 ALX1Q15699 326 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 SPC24Q8NBT2 197 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 TRIM5Q9C035 493 aa22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 FTOQ9C0B1 505 aaKnown RBP eCLIP22.82■■□□□ 1.24
SPNS1-201ENST00000311008 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP22.82■■□□□ 1.24
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