RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000297316.4

SOX17-201, Transcript of SRY-box 17, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SOX17, Length 2,342 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX17-201ENST00000297316 ADD2P35612 726 aa25.47■■□□□ 1.67
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SOX17-201ENST00000297316 DOCK2Q92608 1830 aa25.46■■□□□ 1.67
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SOX17-201ENST00000297316 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa25.39■■□□□ 1.66
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SOX17-201ENST00000297316 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa25.38■■□□□ 1.65
SOX17-201ENST00000297316 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP25.38■■□□□ 1.65
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SOX17-201ENST00000297316 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP25.36■■□□□ 1.65
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SOX17-201ENST00000297316 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
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SOX17-201ENST00000297316 ARMT1Q9H993 441 aa25.33■■□□□ 1.65
SOX17-201ENST00000297316 GPSM2P81274 684 aa25.32■■□□□ 1.64
SOX17-201ENST00000297316 MIGA1Q8NAN2 632 aa25.32■■□□□ 1.64
SOX17-201ENST00000297316 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SOX17-201ENST00000297316 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
SOX17-201ENST00000297316 NRXN2Q9P2S2 1712 aa25.32■■□□□ 1.64
SOX17-201ENST00000297316 APPP05067 770 aa25.31■■□□□ 1.64
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