RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 NR2E3Q9Y5X4 410 aa10.16□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 CCT4P50991 539 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0825Q8IV33 1275 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 MYD88Q99836 296 aa10.15□□□□□ -0.78
PGGT1B-201ENST00000296642 H0YGN5 161 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CHL1O00533 1208 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CAPN2P17655 700 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TMPOP42166 694 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 NEXNQ0ZGT2 675 aa10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 KIAA0100Q14667 2235 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF804BA4D1E1 1349 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPC1 479 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 HOXD10P28358 340 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2A2P52657 109 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MTMR14Q8NCE2 650 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MPHOSPH8Q99549 860 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MINPP1Q9UNW1 487 aa10.13□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TNNI2P48788 182 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CTSWP56202 376 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 GTF2IP78347 998 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 NEUROD2Q15784 382 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 OTUD5Q96G74 571 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 VEZTQ9HBM0 779 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 ZCCHC17Q9NP64 241 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CSADQ9Y600 493 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa10.12□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL15-CCL14A0A0B4J2E2 113 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CCL15Q16663 113 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 OPTNQ96CV9 577 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 HOOK2Q96ED9 719 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CLMNQ96JQ2 1002 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MXD3Q9BW11 206 aa10.11□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 FKBP1AP62942 108 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 UBXN2AP68543 259 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF804AQ7Z570 1209 aa10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 LAMB1P07942 1786 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 USP2O75604 605 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 MYCP01106 439 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CETPP11597 493 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 RASA3Q14644 834 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 KRT24Q2M2I5 525 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CFAP100Q494V2 611 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC30Q5VVM6 783 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TTLL11Q8NHH1 800 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 RAET1EQ8TD07 263 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM47Q96LD4 638 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 ELP3Q9H9T3 547 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CD209Q9NNX6 404 aa10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PGGT1B-201ENST00000296642 CLRN2A0PK11 232 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 F8W031 263 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TLR2O60603 784 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K9P80192 1104 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 RUNDC1Q96C34 613 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GREM2Q9H772 168 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 FZD1Q9UP38 647 aa10.08□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GNAI1P63096 354 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SNAPC2Q13487 334 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 RALBP1Q15311 655 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SH3TC2Q8TF17 1288 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PTPN18Q99952 460 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 STK31Q9BXU1 1019 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 TMOD2Q9NZR1 351 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ECM29Q5VYK3 1845 aa10.07□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 COL4A1P02462 1669 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 EVI5O60447 810 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GJB1P08034 283 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ITGA6P23229 1130 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GRK4P32298 578 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GJA8P48165 433 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 KSR2Q6VAB6 950 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 ERO1BQ86YB8 467 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 BRI3BPQ8WY22 251 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MS4A4AQ96JQ5 239 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 MYH16Q9H6N6 1097 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 SERPINA10Q9UK55 444 aa10.06□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 FMNL1O95466 1100 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GJA5P36382 358 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 CHRNDQ07001 517 aa10.05□□□□□ -0.8
PGGT1B-201ENST00000296642 GPR153Q6NV75 609 aa10.05□□□□□ -0.8
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