RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000270792.9

SH3BGRL3-201, Transcript of SH3 domain binding glutamate rich protein like 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BGRL3, Length 1,661 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C22orf23Q9BZE7 217 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COA1Q9GZY4 146 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SNRKQ9NRH2 765 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa24.69■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ECE2O60344 883 aa24.68■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ATP5JP18859 108 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RASGRF1Q13972 1273 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 BOLA2Q9H3K6 86 aa24.67■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 YDJCA8MPS7 323 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 LMNB1P20700 586 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHMLP26374 656 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MCAMP43121 646 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TDRD7Q8NHU6 1098 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VPS33BQ9H267 617 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IL1R1P14778 569 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 NIM1KQ8IY84 436 aa24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GNL3LQ9NVN8 582 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EVI5LQ96CN4 794 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DDRGK1Q96HY6 314 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RNF181Q9P0P0 153 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HMG20BQ9P0W2 317 aa24.65■■□□□ 1.54
SH3BGRL3-201ENST00000270792 UQCRFS1P1P0C7P4 283 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 JDP2Q8WYK2 163 aa24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP24.64■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHD4Q14839 1912 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 C9orf131Q5VYM1 1079 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FBXW7Q969H0 707 aa24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP24.63■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RBM25P49756 843 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GTF2IP78347 998 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PODNQ7Z5L7 613 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SPATA5Q8NB90 893 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DNAJC2Q99543 621 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNRF3Q9ULT6 936 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RAD17O75943 681 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 REC8O95072 547 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZAP70P43403 619 aa24.62■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MXD3Q9BW11 206 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SBF1O95248 1867 aa24.61■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SCN9AQ15858 1988 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DENND2AQ9ULE3 1009 aa24.6■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HAUS7Q99871 368 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ANTXR1Q9H6X2 564 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SEMA3EO15041 775 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TTLL5Q6EMB2 1281 aa24.59■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GOLIM4O00461 696 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CXCL9Q07325 125 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 AKAP11Q9UKA4 1901 aa24.58■■□□□ 1.53
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FZD9O00144 591 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 HIP1O00291 1037 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP26Q9BXU7 913 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RFX7Q2KHR2 1363 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH7P12883 1935 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.57■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L3A6NCW0 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L4A6NCW7 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PSMD14O00487 310 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GRIK5Q16478 980 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 USP17L1Q7RTZ2 530 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FAM205AQ6ZU69 1335 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CERS5Q8N5B7 392 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PAG1Q9NWQ8 432 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ABCF2Q9UG63 623 aa24.56■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MFSD14BQ5SR56 506 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DACT2Q5SW24 774 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 STRIP1Q5VSL9 837 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RUFY2Q8WXA3 655 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 FSD1Q9BTV5 496 aa24.55■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EIF6P56537 245 aaKnown RBP24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CIAPIN1Q6FI81 312 aa24.54■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 SGSM2O43147 1006 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 WDR66Q8TBY9 1149 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 ZBTB22O15209 634 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PRDX5P30044 214 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 GJA3Q9Y6H8 435 aa24.53■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 PDS5AQ29RF7 1337 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 MYH13Q9UKX3 1938 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 TICAM2Q86XR7 235 aa24.52■■□□□ 1.52
SH3BGRL3-201ENST00000270792 F8W031 263 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 VIL1P09327 827 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CWC27Q6UX04 472 aaKnown RBP24.51■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 IDH1O75874 414 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 CHGBP05060 677 aa24.5■■□□□ 1.51
SH3BGRL3-201ENST00000270792 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.5 ms