RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000086471.11

Suds3-201, Transcript of Sin3 histone deacetylase corepressor complex component SDS3, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Suds3, Length 2,425 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Suds3-201ENSMUST00000086471 Babam1Q3UI43 333 aa27.45■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 DpydQ8CHR6 1025 aa27.45■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cnot6lQ8VEG6 555 aa27.45■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myh4Q5SX39 1939 aa27.44■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm29094F6Q785 221 aa27.44■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stat5bP42232 786 aa27.44■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 MthfsQ9D110 203 aa27.44■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 FosbP13346 338 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cct2P80314 535 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dok7Q18PE0 504 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cyp24a1Q64441 514 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fchsd1Q6PFY1 688 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Izumo3A6PWV3 263 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eef2kO08796 724 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 FanccP50652 591 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Exosc10P56960 887 aaKnown RBP27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prdm1Q60636 856 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Carmil3Q3UFQ8 1375 aa27.43■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r21Q3TDD9 780 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 SfswapQ3USH5 945 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Strip1Q8C079 837 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pms1Q8K119 917 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myh15E9Q264 1925 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gadd45bP22339 160 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dynll1P63168 89 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atad2Q8CDM1 1040 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 HdlbpQ8VDJ3 1268 aaKnown RBP27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Eaf2Q91ZD6 262 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myh3P13541 1940 aa27.42■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 NsmfQ99NF2 532 aa27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mast3Q3U214 1321 aa27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Col4a5Q63ZW6 1691 aa27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 St5Q924W7 1134 aa27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Dydc2Q9D3X8 139 aa27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pes1Q9EQ61 584 aaKnown RBP27.41■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mcm4P49717 862 aa27.4■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 4933416C03RikQ3V063 378 aa27.4■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rbm43Q99J64 343 aa27.4■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc7a3P70423 618 aa27.4■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stx6Q9JKK1 255 aa27.4■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 CrcpO35427 148 aa27.39■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbln2P37889 1221 aa27.39■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Stat1P42225 749 aa27.39■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gja5Q01231 358 aa27.39■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Alx1Q8C8B0 326 aa27.39■■□□□ 1.98
Suds3-201ENSMUST00000086471 Frmd7A2AD83 703 aa27.39■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc4a4O88343 1079 aa27.39■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Heg1E9Q7X6 1337 aa27.39■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxl16A2RT62 479 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prss40A6H6T1 365 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Nxf7Q80SZ6 620 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Me3Q8BMF3 604 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pald1P70261 859 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdcp1Q5U462 833 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ppp1r10Q80W00 888 aaKnown RBP27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Iffo2Q8R2V2 512 aa27.38■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Pet2A2AHY8 747 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Lipo1J3QME6 396 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Psd3Q2PFD7 1037 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Efcc1Q9JJF6 558 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Togaram1Q6A070 1776 aaKnown RBP27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Vmn2r23E9PXI5 849 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tuft1O08970 390 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Bnip3O55003 187 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Olfm5Q8BU90 496 aa27.37■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 NesQ6P5H2 1864 aaKnown RBP27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 NppbP40753 121 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc51Q3URS9 406 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gm5592Q3V0A6 857 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myl10Q62082 202 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Prl7d1P04769 244 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 NapbP28663 298 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Agtpbp1Q641K1 1218 aa27.36■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Adam1bQ8R534 806 aa27.35■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Atp6v0a2P15920 856 aa27.35■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Znf692Q3U381 531 aa27.35■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 ImmtQ8CAQ8 757 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Mad1l1Q9WTX8 717 aaKnown RBP27.35■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fsd1Q7TPM6 496 aa27.34■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cfap69Q8BH53 942 aa27.34■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slfn1Q9Z0I7 337 aa27.34■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Spata31d1bE9QA57 1361 aa27.34■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Myo3bQ1EG27 1305 aa27.34■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 A0A1W2P7S8 802 aa27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Cdc5lQ6A068 802 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Tmem59lQ7TNI2 337 aa27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ythdc1E9Q5K9 736 aaKnown RBP27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Krt40Q6IFX3 439 aa27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fbxo41Q6NS60 873 aa27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Alg3Q8K2A8 438 aa27.33■■□□□ 1.97
Suds3-201ENSMUST00000086471 Slc44a4Q91VA1 707 aa27.32■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 RarsQ9D0I9 660 aaKnown RBP27.32■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ncaph2Q8BSP2 607 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 1700018B08RikQ9DA83 213 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Zbtb43Q9DAI4 467 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Rbbp6P97868 1790 aaKnown RBP27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ccdc66Q6NS45 935 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Fsd2Q8BZ52 692 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Gripap1Q8VD04 806 aa27.31■■□□□ 1.96
Suds3-201ENSMUST00000086471 Ltn1Q6A009 1767 aa27.31■■□□□ 1.96
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 27.7 ms