RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000596332.1

LIG1-210, Transcript of DNA ligase 1, humanhuman

TSL 2

Gene LIG1, Length 584 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1-210ENST00000596332 SONP18583 2426 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PDCD5O14737 125 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SH2D1BO14796 132 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 DEGS1O15121 323 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PAHP00439 452 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CSN2P05814 226 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 UBBP0CG47 229 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MYL9P24844 172 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 GLIPR1P48060 266 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PSMD7P51665 324 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 BMXP51813 675 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CAPZA1P52907 286 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PAX5Q02548 391 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 GPR176Q14439 515 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ZNF273Q14593 569 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SPCS2Q15005 226 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 RAB11BQ15907 218 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 KLF17Q5JT82 389 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SFXN4Q6P4A7 337 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NLRC3Q7RTR2 1065 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 OR8H2Q8N162 312 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 GAPTQ8N292 157 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 BPIFB2Q8N4F0 458 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TPRX1Q8N7U7 411 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SUMF2Q8NBJ7 301 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TMEM185AQ8NFB2 350 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 OR5H6Q8NGV6 325 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ST8SIA4Q92187 359 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TNFRSF14Q92956 283 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CHST6Q9GZX3 395 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TMEM160Q9NX00 188 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 KCNK7Q9Y2U2 307 aa8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.7□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A10PA6NDY2 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A18PA6NE21 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A16PA6NEW6 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A7PA6NKC0 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 A8MV72 311 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A22PA8MWA6 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A12PA8MX19 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 RAB27BO00194 218 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SOCS1O15524 211 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MPIG6BO95866 241 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ECDO95905 644 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 IL1AP01583 271 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A15PP0C7V4 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A13PP0C7W8 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A14PP0C7W9 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 FAM90A24PP0C7X0 464 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ARSBP15848 533 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CHATP28329 748 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ERP29P30040 261 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 DLX1P56177 255 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SCN1BQ07699 218 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 AESQ08117 197 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MPV17LQ2QL34 196 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CR1LQ2VPA4 569 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MOGAT2Q3SYC2 334 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TIMM50Q3ZCQ8 353 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 LRRC10Q5BKY1 277 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PLAC9Q5JTB6 97 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 UTF1Q5T230 341 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 RSBN1Q5VWQ0 802 aaPredicted RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 HCP5Q6MZN7 132 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 OR2W3Q7Z3T1 314 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 GPR141Q7Z602 305 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 C5orf24Q7Z6I8 188 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CHST4Q8NCG5 386 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 OR4M1Q8NGD0 313 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 KCNG3Q8TAE7 436 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NDNFQ8TB73 568 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 DYRK2Q92630 601 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 SLC25A46Q96AG3 418 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 POM121Q96HA1 1249 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 DMRTB1Q96MA1 342 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 TBX15Q96SF7 602 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MRI1Q9BV20 369 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PPA2Q9H2U2 334 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 LIN7BQ9HAP6 207 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PLGRKTQ9HBL7 147 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 YAE1D1Q9NRH1 226 aa8.69□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CUBNO60494 3623 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ZFHX3Q15911 3703 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NKX6-3A6NJ46 265 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 INAFM1C9JVW0 142 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MGST3O14880 152 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 MMP23AO75900 390 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 CSTBP04080 98 aaKnown RBP8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 PPIAL4GP0DN37 164 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 ZNF44P15621 663 aa8.68□□□□□ -1.02
LIG1-210ENST00000596332 NDUFB7P17568 137 aa8.68□□□□□ -1.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 51.5 ms