RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000589162.1

CAPNS1-208, Transcript of calpain small subunit 1, humanhuman

TSL 3

Gene CAPNS1, Length 701 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPNS1-208ENST00000589162 BPESC1Q9GZL8 116 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CST11Q9H112 138 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MMP27Q9H306 513 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CXorf56Q9H5V9 222 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM165Q9HC07 324 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 AKIP1Q9NQ31 210 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF701Q9NV72 531 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IL36GQ9NZH8 169 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 AK3Q9UIJ7 227 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF222Q9UK12 451 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ITGB1BP2Q9UKP3 347 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMA7Q9Y2S6 64 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PEX16Q9Y5Y5 336 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ETV7Q9Y603 341 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PLCE1Q9P212 2302 aa5.02□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IGHV4-61A0A0C4DH41 118 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LINC00854A0A1B0GVQ3 168 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC30A6NM36 301 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CEACAM18A8MTB9 384 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MFNGO00587 321 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PHF1O43189 567 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LANCL1O43813 399 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 HLA-DQB1P01920 261 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 APOA1P02647 267 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CD3GP09693 182 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB6AP20340 208 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DNASE1P24855 282 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CHATP28329 748 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 S100A5P33763 92 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR3A1P47881 315 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ERVFRD-1P60508 538 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 BTG1P62324 171 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DGCR2P98153 550 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 AESQ08117 197 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LSAMPQ13449 338 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IL18Q14116 193 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DEFB113Q30KQ7 82 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SMIM21Q3B7S5 101 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF260Q3ZCT1 412 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMEM69Q5SWH9 247 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 UTF1Q5T230 341 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TEX36Q5VZQ5 186 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 C17orf107Q6ZR85 190 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 Q6ZTK2 550 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CDH24Q86UP0 819 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GVQW1Q8N7I0 195 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 Q8NFD4 153 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR4K15Q8NH41 348 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ANGPTL6Q8NI99 470 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SETD6Q8TBK2 473 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RAB3CQ96E17 227 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 COQ2Q96H96 371 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 URM1Q9BTM9 101 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DPCDQ9BVM2 203 aaPredicted RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ABCG5Q9H222 651 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LPAR2Q9HBW0 351 aa5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.01□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 USF3Q68DE3 2245 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FABP12A6NFH5 140 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 DVL1O14640 695 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 SH2D1BO14796 132 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TMPRSS2O15393 492 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PDCD6O75340 191 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF737O75373 536 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 KNG1P01042 644 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ACAA1P09110 424 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 RPS2P15880 293 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 HIST1H1DP16402 221 aaKnown RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 NDUFB7P17568 137 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 HOXA5P20719 270 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CPT2P23786 658 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CFHR2P36980 270 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GLIPR1P48060 266 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PDLIM4P50479 330 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 EDDM3BP56851 147 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ARFRP1Q13795 201 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GPR176Q14439 515 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 IL13RA2Q14627 380 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 GRK1Q15835 563 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 BAK1Q16611 211 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 MICBQ29980 383 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CLEC12BQ2HXU8 276 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF181Q2M3W8 571 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 PYDC2Q56P42 97 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 Q5PR19 223 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 ZNF788Q6ZQV5 615 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 TCF23Q7RTU1 214 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 LRRC28Q86X40 367 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 FAM89BQ8N5H3 189 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR56B1Q8NGI3 324 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 OR52I2Q8NH67 350 aa5□□□□□ -1.61
CAPNS1-208ENST00000589162 CLDND2Q8NHS1 167 aa5□□□□□ -1.61
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