RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568412.5

TCF25-222, Transcript of transcription factor 25, human

TSL 3

Gene TCF25, Length 797 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TCF25-222	ENST00000568412	GNGT2	O14610	69 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	RPLP1	P05386	114 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ANXA8	P13928	327 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	TMEM11	P17152	192 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	POU3F4	P49335	361 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	RBP2	P50120	134 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ATP1B3	P54709	279 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	KIR2DS1	Q14954	304 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	C17orf58	Q2M2W7	97 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	DEFB136	Q30KP8	78 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	BCDIN3D	Q7Z5W3	292 aa	Known RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	CATSPERD	Q86XM0	798 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	OR9G1	Q8NH87	305 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ADGRL4	Q9HBW9	690 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ZNF446	Q9NWS9	450 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	CLN6	Q9NWW5	311 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ZNF256	Q9Y2P7	627 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		13.1	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	LCE6A	A0A183	80 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412		A0A1W2PPI3	338 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ZNF729	A6NN14	1252 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	PRKY	O43930	277 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	LYL1	P12980	280 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	NFYB	P25208	207 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	MNAT1	P51948	309 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	MTCP1	P56278	107 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	DOC2B	Q14184	412 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	PNLIPRP3	Q17RR3	467 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	LCNL1	Q6ZST4	164 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ARHGAP24	Q8N264	748 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	YIPF7	Q8N8F6	280 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	CCDC54	Q8NEL0	328 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	RCHY1	Q96PM5	261 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	ADI1	Q9BV57	179 aa		13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	AMMECR1	Q9Y4X0	333 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
TCF25-222	ENST00000568412	DNAH1	Q9P2D7	4330 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	KBTBD11-OT1	A0A1B0GTJ5	212 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412		J3QR06	171 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	KRT8	P05787	483 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CDX1	P47902	265 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CRISP1	P54107	249 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	HSP90B2P	Q58FF3	399 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	KRBOX4	Q5JUW0	171 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SSX6	Q7RTT6	188 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PP6455	Q8WZ26	134 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	C10orf35	Q96D05	121 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	COQ2	Q96H96	371 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	KIRREL1	Q96J84	757 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	HRASLS5	Q96KN8	279 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ING3	Q9NXR8	418 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	H2AFY2	Q9P0M6	372 aa	Predicted RBP	13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SMAD5-AS1	Q9Y6J3	95 aa		13.08	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412		B2RBV5	119 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	AP4M1	O00189	453 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGKV1D-33	P01593	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGKV1-33	P01594	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGKV1D-12	P01611	117 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CSN2	P05814	226 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CGB3	P0DN86	165 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CGB7	P0DN87	165 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SCN1B	Q07699	218 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	MADCAM1	Q13477	382 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	DIAPH2-AS1	Q14236	149 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CXorf66	Q5JRM2	361 aa	Predicted RBP	13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	AADACL4	Q5VUY2	407 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SBSPON	Q8IVN8	264 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	LRGUK	Q96M69	825 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	COMMD4	Q9H0A8	199 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	OR6C3	Q9NZP0	311 aa		13.07	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	IGHV3-7	P01780	117 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ZNF44	P15621	663 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PRKACB	P22694	351 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	RAB7A	P51149	207 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	FOXE3	Q13461	319 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	GPR50	Q13585	617 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PTGES3	Q15185	160 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ZNF260	Q3ZCT1	412 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412		Q6P435	159 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	OR8H3	Q8N146	312 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	RNF152	Q8N8N0	203 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	CANT1	Q8WVQ1	401 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	LEAP2	Q969E1	77 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ADAT3	Q96EY9	351 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	GON7	Q9BXV9	100 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PPIL3	Q9H2H8	161 aa	Known RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PALMD	Q9NP74	551 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	PSG11	Q9UQ72	335 aa		13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SIRT4	Q9Y6E7	314 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	LOC107986453	A0A1B0GWG9	222 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	METTL15	A6NJ78	407 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412		M0R129	80 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	KDM4B	O94953	1096 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ELANE	P08246	267 aa		13.05	□□□□□ -0.32
TCF25-222	ENST00000568412	ATF1	P18846	271 aa		13.05	□□□□□ -0.32

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