RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533653.5

GMDS-AS1-211, humanhuman

TSL 2

Gene GMDS-AS1, Length 568 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 hADV38S2A0JD32 116 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 H3BUI4 141 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCF21O43680 179 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CDRT1O95170 752 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HTR3BO95264 441 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SERPINA2P20848 420 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSMB9P28065 219 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DUSP1P28562 367 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PSMD7P51665 324 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SNU13P55769 128 aaKnown RBP13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC22A6Q4U2R8 563 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SYT6Q5T7P8 510 aaPredicted RBP13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VMO1Q7Z5L0 202 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR6M1Q8NGM8 313 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 JMJD8Q96S16 334 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CST11Q9H112 138 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SPACA1Q9HBV2 294 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 VCX3AQ9NNX9 186 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ING4Q9UNL4 249 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ST3GAL6Q9Y274 331 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 LINC00312Q9Y6C7 94 aa13.5□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A10PA6NDY2 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A18PA6NE21 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A16PA6NEW6 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A7PA6NKC0 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A22PA8MWA6 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A12PA8MX19 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SIRPB1O00241 398 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DEGS1O15121 323 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A15PP0C7V4 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A13PP0C7W8 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A14PP0C7W9 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FAM90A24PP0C7X0 464 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGHV4-38-2P0DP08 117 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PRTN3P24158 256 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CALRP27797 417 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 P2RX3P56373 397 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EDDM3BP56851 147 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C1orf100Q5SVJ3 147 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 Q8N7P7 452 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4D6Q8NGJ1 314 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MS4A7Q9GZW8 240 aaPredicted RBP13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF696Q9H7X3 374 aa13.49□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A087WXM4 84 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAV1-2A0A0B4J238 106 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 A0A0G2JK05 382 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC22A1O15245 554 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CALCBP10092 127 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CFPP27918 469 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 EDDM3AQ14507 147 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PIGYQ3MUY2 71 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TMEM200BQ69YZ2 307 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4S1Q8NGB4 309 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR10K1Q8NGX5 313 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 NKX3-1Q99801 234 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CHST6Q9GZX3 395 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ATRQ13535 2644 aa13.48□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGHV1-69DA0A0B4J2H0 117 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC17A2O00624 439 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 IGHV1-69P01742 117 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF728P0DKX0 622 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MYL9P24844 172 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HTR2CP28335 458 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 HILS1P60008 231 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF273Q14593 569 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR4M1Q8NGD0 313 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZFAND2BQ8WV99 257 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF714Q96N38 554 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 SLC6A7Q99884 636 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PPA2Q9H2U2 334 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RCC2Q9P258 522 aaKnown RBP13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ZNF69Q9UC07 566 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 STUB1Q9UNE7 303 aa13.47□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TRAV24A0A0B4J272 114 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 C17orf98A8MV24 154 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 PDCD5O14737 125 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 BPNT1O95861 308 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 MGMTP16455 207 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 DLX6P56179 175 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 ERVFRD-1P60508 538 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 RBMS3Q6XE24 437 aaKnown RBP13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TCF23Q7RTU1 214 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TSPAN14Q8NG11 270 aa13.46□□□□□ -0.25
GMDS-AS1-211ENST00000533653 TNFRSF14Q92956 283 aa13.46□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31.6 ms