RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000517083.1

RNU6-548P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 548, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-548P, Length 115 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-548P-201ENST00000517083 SETD9Q8NE22 299 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FBXO36Q8NEA4 188 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LFNGQ8NES3 379 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CSNK2A3Q8NEV1 391 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4B1Q8NGF8 309 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR4C15Q8NGM1 316 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR2AE1Q8NHA4 323 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RASSF5Q8WWW0 418 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MARC2Q969Z3 335 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF799Q96GE5 643 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 USMG5Q96IX5 58 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EGLN2Q96KS0 407 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FCRL1Q96LA6 429 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBXN10Q96LJ8 280 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C7orf26Q96N11 449 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRNT1Q96Q11 434 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCT7Q99832 543 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MRPL13Q9BYD1 178 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF436Q9C0F3 470 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TMEM27Q9HBJ8 222 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 INIPQ9NRY2 104 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM206AQ9NX38 181 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIRT5Q9NXA8 310 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SMPD3Q9NY59 655 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CALML5Q9NZT1 146 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MARCOQ9UEW3 520 aaPredicted RBP1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MLXQ9UH92 298 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF229Q9UJW7 825 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PCTPQ9UKL6 214 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SLC7A11Q9UPY5 501 aa1.3□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1D-42A0A075B6H8 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV7-81A0A0B4J1V7 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRAV5A0A0B4J249 113 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 A0A1W2PPE3 182 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TCRBV7S2A1N4TA0A589 114 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PRSS37A4D1T9 235 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 A6NIZ1 184 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF705EA8MWA4 302 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MIF4GDA9UHW6 222 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 F5H768 121 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF593O00488 134 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SIVA1O15304 175 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 NBR2O15453 112 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 XRCC2O43543 280 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GGCTO75223 188 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MMP23AO75900 390 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRBV12-3P01733 135 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IGHV3-7P01780 117 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TPM1P09493 284 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ACSM4P0C7M7 580 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SPP1P10451 314 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRYGAP11844 174 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYOD1P15172 320 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FUT1P19526 365 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CD247P20963 164 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRTAP5-9P26371 169 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 EPHA2P29317 976 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 OR1E2P47887 323 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GPM6AP51674 278 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HMGA2P52926 109 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CRISP3P54108 245 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HADHBP55084 474 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 F2RL1P55085 397 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 UBE2KP61086 200 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAP1BP61224 184 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LSM6P62312 80 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RAP1AP62834 184 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 RPL38P63173 70 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GNG3P63215 75 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HOXC5Q00444 222 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 MYL5Q02045 173 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 C2orf54Q08AI8 447 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 DIAPH2-AS1Q14236 149 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 SYPL1Q16563 259 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF74Q16587 644 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LTC4SQ16873 150 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ODF3L2Q3SX64 289 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GTDC1Q4AE62 458 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF585BQ52M93 769 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 AKIRIN2Q53H80 203 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 GLYATL3Q5SZD4 288 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 IBA57Q5T440 356 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF343Q6P1L6 599 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ZNF529Q6P280 563 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 PGM2L1Q6PCE3 622 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 TTC33Q6PID6 262 aaPredicted RBP1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 FAM220AQ7Z4H9 259 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 LRRTM1Q86UE6 522 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 KRT73Q86Y46 540 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 ANKMY2Q8IV38 441 aa1.29□□□□□ -2.2
RNU6-548P-201ENST00000517083 HSCBQ8IWL3 235 aa1.29□□□□□ -2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36 ms