RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493660.5

SMARCE1-211, Transcript of SWI/SNF related, matrix associated, actin dependent regulator of chromatin, subfamily e, member 1, humanhuman

TSL 3

Gene SMARCE1, Length 2,284 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1-211ENST00000493660 CD8B2A6NJW9 211 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CYB5BO43169 146 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TOMM40O96008 361 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ARG1P05089 322 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CD8BP10966 210 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CD80P33681 288 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAUP35544 74 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF85Q03923 595 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RAB11BQ15907 218 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PCK2Q16822 640 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR2G6Q5TZ20 316 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35E3Q7Z769 313 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ADGRE4PQ86SQ3 457 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC01551Q86U37 167 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 NR2C2APQ86WQ0 139 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC35G3Q8N808 338 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 INO80EQ8NBZ0 244 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC26A10Q8NG04 563 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR51L1Q8NGJ5 315 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CD300LFQ8TDQ1 290 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ASB17Q8WXJ9 295 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 GHSRQ92847 366 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TAAR6Q96RI8 345 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TP53RKQ96S44 253 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SYT3Q9BQG1 590 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 EMC6Q9BV81 110 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LINC00470Q9BZP3 86 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PLSCR4Q9NRQ2 329 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FOXJ3Q9UPW0 622 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AKAP13Q12802 2813 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ARHGAP21Q5T5U3 1957 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MED12Q93074 2177 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CNTRLQ7Z7A1 2325 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 K7EM74 188 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 XRCC3O43542 346 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C1QTNF9P0C862 333 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SERPINA2P20848 420 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RPL29P47914 159 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SELENOVP59797 346 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PAX5Q02548 391 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SRYQ05066 204 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SPOCK1Q08629 439 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FAM180AQ6UWF9 173 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 BTNL8Q6UX41 500 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AAED1Q7RTV5 226 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C1orf87Q8N0U7 546 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6N1Q8NGY5 312 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OTOSQ8NHW6 89 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MCHR2Q969V1 340 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR8B4Q96RC9 309 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HRH4Q9H3N8 390 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 AUNIPQ9H7T9 357 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TRIM36Q9NQ86 728 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CLCF1Q9UBD9 225 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 MMP24Q9Y5R2 645 aa6.29□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A087WWC5 75 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 A0A0G2JK05 382 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM272A0A1B0GTI8 110 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC22A20A6NK97 555 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PYCARD-AS1I3L0S3 204 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC25A17O43808 307 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CTAG2O75638 210 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 HLA-DQA2P01906 255 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CD1AP06126 327 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF823P16415 610 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 S100A7P31151 101 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 CCKARP32238 428 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TAS2R19P59542 299 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2G2P60604 165 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 RANP62826 216 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 FMODQ06828 376 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ARL6IP1Q15041 203 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TAF9Q16594 264 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 UBE2NLQ5JXB2 153 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 SLC18B1Q6NT16 456 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF705AQ6ZN79 300 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LYG1Q8N1E2 194 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 C15orf40Q8WUR7 153 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PGAM5Q96HS1 289 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM56Q96MV1 263 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TECTBQ96PL2 329 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ARV1Q9H2C2 271 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 PARP11Q9NR21 331 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 TMEM56-RWDD3S4R434 201 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 ZNF407Q9C0G0 2248 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 DNAJC13O75165 2243 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 LOC105371242A0A075B767 164 aa6.28□□□□□ -1.4
SMARCE1-211ENST00000493660 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.28□□□□□ -1.4
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