RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 PAX6P26367 422 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CEACAM8P31997 349 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ATP1B3P54709 279 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 RPS27AP62979 156 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PLGLB1Q02325 96 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 RAB35Q15286 201 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TGIF1Q15583 401 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR1C1Q15619 314 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A42Q86VD7 318 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZADH2Q8N4Q0 377 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR2M7Q8NG81 312 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TERB2Q8NHR7 220 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FNDC9Q8TBE3 224 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PPP1R1CQ8WVI7 109 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PP6455Q8WZ26 134 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 DYRK2Q92630 601 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ADGRG7Q96K78 797 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PRRG4Q9BZD6 226 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 GPR35Q9HC97 309 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PLEKHJ1Q9NW61 149 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 EHFQ9NZC4 300 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 METTL1Q9UBP6 276 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 BOKQ9UMX3 212 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1D-8A0A087WSZ0 117 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HSPA12AO43301 675 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 YIF1AO95070 293 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 KNG1P01042 644 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SERPINA5P05154 406 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF44P15621 663 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HNF1AP20823 631 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CRYGSP22914 178 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HIST1H3AP68431 136 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 DHODHQ02127 395 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF92Q03936 586 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TLE1Q04724 770 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SURF2Q15527 256 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PDZD11Q5EBL8 140 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CDPF1Q6NVV7 123 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HIST2H3AQ71DI3 136 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SULF2Q8IWU5 870 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR5M8Q8NGP6 311 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PIGCQ92535 297 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PHB2Q99623 299 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TMPRSS13Q9BYE2 586 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A32Q9H2D1 315 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PIGMQ9H3S5 423 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SLC7A10Q9NS82 523 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FBLN5Q9UBX5 448 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 V9GYS6 101 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HMSDA8MTL9 139 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 AP4M1O00189 453 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 IGLV3-1P01715 115 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HLA-HP01893 362 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 GLRA1P23415 457 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 GFRA1P56159 465 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 NUTF2P61970 127 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MPPED2Q15777 294 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF660Q6AZW8 331 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 DRAM2Q6UX65 266 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TUSC5Q8IXB3 177 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR10D4PQ8NGN7 298 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MARS2Q96GW9 593 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FAAP24Q9BTP7 215 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF471Q9BX82 626 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PECRQ9BY49 303 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SLC2A8Q9NY64 477 aa6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF107Q9UII5 783 aaPredicted RBP6.05□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ADAP1O75689 374 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 UBBP0CG47 229 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CPT2P23786 658 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TIMP3P35625 211 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ARF1P84077 181 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 GAMTQ14353 236 aa6.04□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 PYY3Q5JQD4 70 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 VASH2Q86V25 355 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 BORCS8Q96FH0 119 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 C2orf88Q9BSF0 95 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR2H1Q9GZK4 316 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 WDR13Q9H1Z4 485 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR51B6Q9H340 312 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 C5orf66Q9H5L9 145 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SMCO4Q9NRQ5 59 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 B4GALT7Q9UBV7 327 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MEMO1Q9Y316 297 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF587BE7ETH6 402 aa6.04□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 DNPH1O43598 174 aa6.04□□□□□ -1.44
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