RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489424.5

HDAC10-216, Transcript of histone deacetylase 10, human

TSL 5

Gene HDAC10, Length 759 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
HDAC10-216	ENST00000489424	MTNR1B	P49286	362 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RAG2	P55895	527 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	BATF2	Q8N1L9	274 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FGFRL1	Q8N441	504 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	JAGN1	Q8N5M9	183 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM185A	Q8NFB2	350 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PPP1R35	Q8TAP8	253 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		14.14	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CLPSL1	A2RUU4	121 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SRM	P19623	302 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RPL31	P62899	125 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OLFML2A	Q68BL7	652 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GLT8D1	Q68CQ7	371 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CD177	Q8N6Q3	437 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C16orf95	Q9H693	158 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HMG20A	Q9NP66	347 aa		14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RBFOX1	Q9NWB1	397 aa	Known RBP	14.13	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		K7N7A8	449 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRP	O00591	440 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GPR137B	O60478	399 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TK1	P04183	234 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MDK	P21741	143 aa	Predicted RBP	14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GAL	P22466	123 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NPBWR2	P48146	333 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PSMD7	P51665	324 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZP1	P60852	638 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF146	Q15072	292 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCC1	Q8N9N2	400 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ORAI1	Q96D31	301 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	UQCC2	Q9BRT2	126 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	EXOSC4	Q9NPD3	245 aa	Known RBP	14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SIRT7	Q9NRC8	400 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	VPREB3	Q9UKI3	123 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GSTK1	Q9Y2Q3	226 aa		14.12	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TSPAN9	O75954	239 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CLPX	O76031	633 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HTR3B	O95264	441 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HAND1	O96004	215 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IGHV4-59	P01825	116 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	UCHL1	P09936	223 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	COL10A1	Q03692	680 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MEF2C	Q06413	473 aa	Predicted RBP	14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ELP2	Q6IA86	826 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ASPHD2	Q6ICH7	369 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SNX22	Q96L94	193 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NDUFB11	Q9NX14	153 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GHRL	Q9UBU3	117 aa		14.11	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1-12	A0A0C4DH73	117 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FUOM	A2VDF0	154 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		F8VVB4	439 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		F8VWA3	439 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	DEGS1	O15121	323 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PIN1P1	O15428	100 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SC5D	O75845	299 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PAH	P00439	452 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IGKV1D-12	P01611	117 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GABRR1	P24046	479 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MYL9	P24844	172 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SAA4	P35542	130 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	OR3A4P	P47883	348 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SNU13	P55769	128 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	RELB	Q01201	579 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	SCN1B	Q07699	218 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NEDD8	Q15843	81 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ASCL4	Q6XD76	172 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf42	Q8N5U0	333 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CHST4	Q8NCG5	386 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	WFDC12	Q8WWY7	111 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TAF15	Q92804	592 aa	Known RBP eCLIP	14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	IL36G	Q9NZH8	169 aa		14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MRPS28	Q9Y2Q9	187 aa	Known RBP	14.1	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	MEIOC	A2RUB1	952 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C17orf98	A8MV24	154 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424		H3BUI4	141 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	PDCD5	O14737	125 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF737	O75373	536 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	UBB	P0CG47	229 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CALCB	P10092	127 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	GTF2F2	P13984	249 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ZNF44	P15621	663 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CALR	P27797	417 aa	Known RBP	14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	CEBPD	P49716	269 aa	Predicted RBP	14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	ERVFRD-1	P60508	538 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	FABP5	Q01469	135 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	INSL4	Q14641	139 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	AWAT2	Q6E213	333 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	HCP5	Q6MZN7	132 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	C11orf88	Q6PI97	169 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		14.09	□□□□□ -0.15
HDAC10-216	ENST00000489424	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		14.09	□□□□□ -0.15

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.5 ms