RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC29	Q8WV35	223 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM203	Q969S6	136 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SPSB1	Q96BD6	273 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DMRTB1	Q96MA1	342 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR14A2	Q96R54	314 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NR1H4	Q96RI1	486 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DCTN5	Q9BTE1	182 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NEK6	Q9HC98	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TAS2R4	Q9NYW5	299 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SF3B6	Q9Y3B4	125 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1-27	A0A075B6S5	117 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV5-7	A0A0A0MS05	114 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PPK0	400 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NDUFB3	O43676	98 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SULT1B1	O43704	296 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PEX14	O75381	377 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RHBDL1	O75783	438 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RAB3A	P20336	220 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MTCP1	P56278	107 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TRAM1	Q15629	374 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF529	Q6P280	563 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	LHFPL2	Q6ZUX7	228 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	AQP3	Q92482	292 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	THRSP	Q92748	146 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ORAI1	Q96D31	301 aa		11.18	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		J3QT63	122 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MAGEB3	O15480	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SYNGR1	O43759	233 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	GPX5	O75715	221 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	INMT	O95050	263 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PF4	P02776	101 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	HCK	P08631	526 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PF4V1	P10720	104 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SELL	P14151	372 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	IGFBP3	P17936	291 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PSMA1	P25786	263 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MAPK3	P27361	379 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PSMB9	P28065	219 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	HOXD3	P31249	432 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RPS25	P62851	125 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PPP3R1	P63098	170 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	INSL4	Q14641	139 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NEDD8	Q15843	81 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SSX1	Q16384	188 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC10	Q5BKY1	277 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	CEACAM19	Q7Z692	300 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	CALHM1	Q8IU99	346 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR51A2	Q8NGJ7	313 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	C8orf46	Q8TAG6	207 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	WIPF2	Q8TF74	440 aa	Predicted RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SEH1L	Q96EE3	360 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RCC1L	Q96I51	464 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	AJUBA	Q96IF1	538 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DERL3	Q96Q80	235 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PKIB	Q9C010	78 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MEGF9	Q9H1U4	602 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		U3KQK5	164 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DNAH7	Q8WXX0	4024 aa		11.17	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PQ09	198 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	C3orf84	H3BNL1	204 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		M0R1W7	72 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	CCRL2	O00421	344 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	AKR7A2	O43488	359 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ANGPTL7	O43827	346 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SC5D	O75845	299 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ALDOB	P05062	364 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ACAA1	P09110	424 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MUC1	P15941	1255 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MPZ	P25189	248 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	IL24	Q13007	206 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	AANAT	Q16613	207 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SYT6	Q5T7P8	510 aa	Predicted RBP	11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	HCP5	Q6MZN7	132 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM91	Q6ZNR0	172 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	LIAT1	Q6ZQX7	453 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RNF144B	Q7Z419	303 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SPACA5	Q96QH8	159 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM138	Q9NPI0	162 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	CKLF	Q9UBR5	152 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	POLDIP2	Q9Y2S7	368 aa		11.16	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TRAV8-7	A0A075B6U6	113 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NOS1AP	O75052	506 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	FST	P19883	344 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	GLRA1	P23415	457 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	BDKRB2	P30411	391 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	GMFB	P60983	142 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	FABP5	Q01469	135 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PDZK1IP1	Q13113	114 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	BLMH	Q13867	455 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	KISS1	Q15726	138 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ARSJ	Q5FYB0	599 aa	Predicted RBP	11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SLC25A26	Q70HW3	274 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SATL1	Q86VE3	508 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MKX	Q8IYA7	352 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		Q8N2B8	174 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	POC1A	Q8NBT0	407 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR5T2	Q8NGG2	359 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR52N4	Q8NGI2	321 aa		11.15	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PHYHIP	Q92561	330 aa		11.15	□□□□□ -0.62

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