RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000487565.5

GARNL3-218, Transcript of GTPase activating Rap/RanGAP domain like 3, humanhuman

TSL 4

Gene GARNL3, Length 554 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GARNL3-218ENST00000487565 RASL12Q9NYN1 266 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NLKQ9UBE8 527 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 IL36RNQ9UBH0 155 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 OR14J1Q9UGF5 321 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 GLS2Q9UI32 602 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CDC42EP3Q9UKI2 254 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RAB22AQ9UL26 194 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 WIPI2Q9Y4P8 454 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PEX16Q9Y5Y5 336 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TACC2O95359 2948 aa6.41□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SPG11Q96JI7 2443 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 CACNA1DQ01668 2161 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PPIAL4EA0A075B759 164 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TRAV38-1A0A0B4J264 116 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PPIAL4DF5H284 164 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 H3BUI4 141 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SSX4O60224 188 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 HAND1O96004 215 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 APOA1P02647 267 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 EIF4EP06730 217 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PPIAL4FP0DN26 164 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF44P15621 663 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PAX1P15863 534 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MUC1P15941 1255 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MDH2P40926 338 aaKnown RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 GPR6P46095 362 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PITPNBP48739 271 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PDLIM4P50479 330 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 HOXA4Q00056 320 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PLA2G7Q13093 441 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MPV17LQ2QL34 196 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 DEFB113Q30KQ7 82 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 FAM201AQ5SY85 155 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 AVPI1Q5T686 147 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TEX36Q5VZQ5 186 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 STUMQ69YW2 141 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 MUC20Q8N307 709 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF525Q8N782 197 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 C19orf18Q8NEA5 215 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 DEFB108BQ8NET1 73 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 Q8NFD4 153 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RAB40AQ8WXH6 277 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 RAB1CQ92928 201 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NINJ1Q92982 152 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SEH1LQ96EE3 360 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 WDFY2Q96P53 400 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 NICN1Q9BSH3 213 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 TM2D1Q9BX74 207 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 LPAR5Q9H1C0 372 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 ST3GAL6Q9Y274 331 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 PPIAL4AQ9Y536 164 aa6.4□□□□□ -1.38
GARNL3-218ENST00000487565 LRBAP50851 2863 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 APCP25054 2843 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 A0A0A6YYH2 397 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A10PA6NDY2 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A18PA6NE21 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A16PA6NEW6 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 A6NJ64 397 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A7PA6NKC0 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RFPL4AA6NLU0 287 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 OR2AT4A6NND4 320 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A22PA8MWA6 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A12PA8MX19 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SIRPB1O00241 398 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CTDSP2O14595 271 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PDCD6O75340 191 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 LHBP01229 141 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 IGHV2-70P01814 119 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A15PP0C7V4 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A13PP0C7W8 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A14PP0C7W9 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 FAM90A24PP0C7X0 464 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ELK1P19419 428 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 COL8A2P25067 703 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 DUSP1P28562 367 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RBMXP38159 391 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 GABRA2P47869 451 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SCN1BQ07699 218 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZNF146Q15072 292 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 ZMYND11Q15326 602 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TAF9Q16594 264 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 PAN3Q58A45 887 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SPANXN2Q5MJ10 180 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 TMEM69Q5SWH9 247 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 RAB12Q6IQ22 244 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 CNIH2Q6PI25 160 aa6.39□□□□□ -1.39
GARNL3-218ENST00000487565 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa6.39□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.8 ms