RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485621.1

TRAPPC10-211, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

TSL 2

Gene TRAPPC10, Length 537 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-211ENST00000485621 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR2H1Q9GZK4 316 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MMADHCQ9H3L0 296 aaPredicted RBP3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 C5orf66Q9H5L9 145 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF442Q9H7R0 627 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 NGBQ9NPG2 151 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARMC1Q9NVT9 282 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FZR1Q9UM11 496 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MGAT4BQ9UQ53 548 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 POFUT2Q9Y2G5 429 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CDH10Q9Y6N8 788 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 U3KQV3 271 aa3.46□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DHRS12A0PJE2 317 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR6C6A6NF89 314 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 A6NIZ1 184 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LYNX1G3V0Z9 82 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TNFRSF11BO00300 401 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RER1O15258 196 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR10H3O60404 316 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SOX14O95416 240 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SNAP29O95721 258 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SERPINA5P05154 406 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GYPBP06028 91 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CST2P09228 141 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR4A8P0C604 315 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 LYNX1P0DP58 116 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLUP10909 449 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 NPR2P20594 1047 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MSR1P21757 451 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CPT2P23786 658 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 IL2RGP31785 369 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PYCR1P32322 319 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GLRXP35754 106 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GGT2P36268 569 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPL4P36578 427 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RPS27P42677 84 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 PPOXP50336 477 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FABP6P51161 128 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAP1BP61224 184 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAP1AP62834 184 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHRNB3Q05901 458 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CD47Q08722 323 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FLOT2Q14254 428 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MICAQ29983 383 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLEC12BQ2HXU8 276 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DNAL1Q4LDG9 190 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CLEC12AQ5QGZ9 265 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 THEM4Q5T1C6 240 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 AGAP6Q5VW22 663 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SHEQ5VZ18 495 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC27A4Q6P1M0 643 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DPY19L2P2Q6ZN68 376 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 Q6ZR03 302 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 C17orf107Q6ZR85 190 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC16A14Q7RTX9 510 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCDC36Q8IYA8 594 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CYB561A3Q8NBI2 242 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC30A7Q8NEW0 376 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SDR9C7Q8NEX9 313 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR10G2Q8NGC3 310 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR9Q1Q8NGQ5 310 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GNPDA2Q8TDQ7 276 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 C10orf105Q8TEF2 133 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 C11orf40Q8WZ69 217 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 YIPF5Q969M3 257 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 DUS3LQ96G46 650 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 AMELYQ99218 206 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CHID1Q9BWS9 393 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RACGAP1Q9H0H5 632 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OR51B6Q9H340 312 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SIAEQ9HAT2 523 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB9BQ9NP90 201 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 IL20Q9NYY1 176 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 B9D1Q9UPM9 204 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 AURKCQ9UQB9 309 aa3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM32AQ9Y421 112 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 HIVEP2P31629 2446 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CUBNO60494 3623 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ARRDC5A6NEK1 342 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 TVP23AA6NH52 213 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZSCAN5BA6NJL1 495 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 FAM183AA6NL82 134 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF732B4DXR9 585 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 M0R129 80 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 GYG2O15488 501 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC16A7O60669 478 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RP2O75695 350 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CCNB2O95067 398 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 RAB36O95755 333 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 CST1P01037 141 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 ZNF250P15622 560 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 SLC2A5P22732 501 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 STOMP27105 288 aa3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 OTX1P32242 354 aaPredicted RBP3.44□□□□□ -1.86
TRAPPC10-211ENST00000485621 MAGEB1P43366 347 aa3.44□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.1 ms