RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468380.1

LINC00888-201, long intergenic non-protein coding RNA 888, humanhuman

TSL 2

Gene LINC00888, Length 1,241 nt, Biotype processed transcript.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00888-201ENST00000468380 PTGFRP43088 359 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 GPR50Q13585 617 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 FHL3Q13643 280 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SPIN3Q5JUX0 258 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 BCDIN3DQ7Z5W3 292 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 HS3ST5Q8IZT8 346 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 OR9G1Q8NH87 305 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 BORCS8Q96FH0 119 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 KIRREL1Q96J84 757 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CHST5Q9GZS9 411 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 HMG20AQ9NP66 347 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 TVP23BQ9NYZ1 205 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa14.58□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 IGKV1-9A0A0C4DH69 117 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 J3QR06 171 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CCRL2O00421 344 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SH2D1BO14796 132 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 RPP14O95059 124 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 GPR12P47775 334 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 MS4A2Q01362 244 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 FOXE3Q13461 319 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SPATS1Q496A3 300 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CXorf66Q5JRM2 361 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PCDHB16Q9NRJ7 776 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ARL8BQ9NVJ2 186 aa14.57□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 AP4M1O00189 453 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SYT7O43581 403 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 IGKV1D-12P01611 117 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PRKACGP22612 351 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 POU3F4P49335 361 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 FAM98BQ52LJ0 330 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 KRBOX4Q5JUW0 171 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 Q6P435 159 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SSX6Q7RTT6 188 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 OR11H1Q8NG94 326 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 HRASLS5Q96KN8 279 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PPIL3Q9H2H8 161 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PLEKHA1Q9HB21 404 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SLC25A19Q9HC21 320 aa14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 FUOMA2VDF0 154 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF729A6NN14 1252 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 GATBO75879 557 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ELANEP08246 267 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 HCKP08631 526 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 RBP2P50120 134 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CFHR3Q02985 330 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SCN1BQ07699 218 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 EBI3Q14213 229 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ASPHD1Q5U4P2 390 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CATSPERDQ86XM0 798 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SLC35F2Q8IXU6 374 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ABCG5Q9H222 651 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ADGRL4Q9HBW9 690 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PSG11Q9UQ72 335 aa14.55□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CST1P01037 141 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ATP1B3P54709 279 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 MTCP1P56278 107 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ACTR3P61158 418 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PDZK1IP1Q13113 114 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 MADCAM1Q13477 382 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 GK3PQ14409 553 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 RDH10Q8IZV5 341 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 Q8N9W7 124 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 DNAAF1Q8NEP3 725 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 C4orf3Q8WVX3 66 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ZMAT4Q9H898 229 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 EDA2RQ9HAV5 297 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PLSCR3Q9NRY6 295 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 TAGLN3Q9UI15 199 aa14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 AMMECR1Q9Y4X0 333 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SIRT4Q9Y6E7 314 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 IGHV3-72A0A0B4J1Y9 119 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 NCBP2LA6PVI3 153 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 PRKYO43930 277 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 SERPINA3P01011 423 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 CSN2P05814 226 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 RAB7AP51149 207 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 INSL3P51460 131 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 FAM53AQ6NSI3 398 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 C16orf89Q6UX73 402 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 DHFR2Q86XF0 187 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 TGIF2LXQ8IUE1 241 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 OR8H3Q8N146 312 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 Q8N6K4 173 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 COMMD4Q9H0A8 199 aa14.53□□□□□ -0.08
LINC00888-201ENST00000468380 A0A1W2PPE3 182 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00888-201ENST00000468380 CYB5AP00167 134 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00888-201ENST00000468380 IGHG4P01861 327 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00888-201ENST00000468380 RAP2AP10114 183 aa14.52□□□□□ -0.09
LINC00888-201ENST00000468380 ZNF44P15621 663 aa14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.8 ms