RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468347.1

SHQ1-204, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 5

Gene SHQ1, Length 134 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-204ENST00000468347 IGHV3-73A0A0B4J1V6 119 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 A0A1W2PNV4 684 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 SMCO2A6NFE2 343 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 HMSDA8MTL9 139 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PSPHP1O15172 72 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 CCL25O15444 150 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 RAD51CO43502 376 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PSTPIP1O43586 416 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR2A4O95047 310 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 MT-ATP6P00846 226 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 GYPCP04921 128 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 ANXA5P08758 320 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 TROVE2P10155 538 aaKnown RBP eCLIP-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PRKACAP17612 351 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 CXCR1P25024 350 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 HTR1DP28221 377 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 RPL28P46779 137 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 SMARCA4P51532 1647 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 SSR4P51571 173 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 CCNHP51946 323 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 OR1Q1Q15612 314 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 CEACAM21Q3KPI0 293 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 UBE2UQ5VVX9 321 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 MROH5Q6ZUA9 1318 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 ANKRD23Q86SG2 305 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 CCDC170Q8IYT3 715 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 CCDC89Q8N998 374 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR4K2Q8NGD2 314 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR1L4Q8NGR5 311 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR4C6Q8NH72 309 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 ORAOV1Q8WV07 137 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 KCTD4Q8WVF5 259 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 KIFAP3Q92845 792 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 C7orf34Q96L11 122 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 IFT74Q96LB3 600 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 NSMCE2Q96MF7 247 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 JSRP1Q96MG2 331 aaPredicted RBP-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 OR2A7Q96R45 310 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 LINC01587Q99440 93 aa-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP-1.02□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 REREQ9P2R6 1566 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 HHLA3Q9XRX5 114 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 SLC22A14Q9Y267 594 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 ZNF257Q9Y2Q1 563 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 MTCH2Q9Y6C9 303 aa-1.02□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 ESPL1Q14674 2120 aa-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 A0A0D9SEW6 157 aa-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 TOR1AO14656 332 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 NDUFS5O43920 106 aa-1.03□□□□□ -2.57
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SHQ1-204ENST00000468347 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 CNBPP62633 177 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 BFSP1Q12934 665 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PMVKQ15126 192 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PDGFRLQ15198 375 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 MAPRE2Q15555 327 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 MRPL23Q16540 153 aaKnown RBP-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 PPM1LQ5SGD2 360 aa-1.03□□□□□ -2.57
SHQ1-204ENST00000468347 STEAP4Q687X5 459 aa-1.03□□□□□ -2.57
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