RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409076.6

SNX13-201, Transcript of sorting nexin 13, humanhuman

TSL 2

Gene SNX13, Length 3,818 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13-201ENST00000409076 RTL10Q7L3V2 364 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RPS19BP1Q86WX3 136 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OR10AD1Q8NGE0 317 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SCGB1C1Q8TD33 95 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ST8SIA1Q92185 356 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 PBDC1Q9BVG4 233 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NMES1Q9C002 83 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC17A5Q9NRA2 495 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CHST1O43916 411 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TCN2P20062 427 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 BCL3P20749 454 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DVL1P1P54792 670 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RHEBQ15382 184 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TRIM61Q5EBN2 209 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TBC1D26Q86UD7 250 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GCNT2Q8N0V5 402 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 POC1AQ8NBT0 407 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 EXTL1Q92935 676 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SEC11CQ9BY50 192 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SRXN1Q9BYN0 137 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 WBP1LQ9NX94 342 aa7.24□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PPQ1 181 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IFNL4K9M1U5 179 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 MFNGO00587 321 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZIC3O60481 467 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CLDN1O95832 211 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GLB1P16278 677 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF345Q14585 488 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 BTNL3Q6UXE8 466 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OSR2Q8N2R0 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TMEM37Q8WXS4 190 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SLC25A22Q9H936 323 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GSN-AS1Q9NRJ2 163 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 COA4Q9NYJ1 87 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 A0A1W2PQM1 296 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ARGFXA6NJG6 315 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF732B4DXR9 585 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 PROB1E7EW31 1015 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NPIPB7O75200 414 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 KRASP01116 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IFNA17P01571 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TK1P04183 234 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 FAM157CP0CG43 387 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 MECP2P51608 486 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CLDN15P56746 228 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SSTP61278 116 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 EWSR1Q01844 656 aaKnown RBP eCLIP7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SPEM2Q0P670 501 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ECH1Q13011 328 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 EDDM3AQ14507 147 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF429Q86V71 674 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF665Q9H7R5 613 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NAA60Q9H7X0 242 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 KPTNQ9Y664 436 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 MTCH2Q9Y6C9 303 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 PTPRSQ13332 1948 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 UBE2L5PA0A1B0GUS4 154 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 LILRA5A6NI73 299 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF587BE7ETH6 402 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GPR137BO60478 399 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NGFP01138 241 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IFNA5P01569 189 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CD1AP06126 327 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 FSTP19883 344 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 LINC00205P59089 165 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DLK1P80370 383 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DEFA6Q01524 100 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 HGFACQ04756 655 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 HES3Q5TGS1 186 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OR2M3Q8NG83 312 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RAB39BQ96DA2 213 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SHDQ96IW2 340 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 TREM2Q9NZC2 230 aa7.23□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IGKV1-27A0A075B6S5 117 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 E5RGE8 158 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 H3BQ15 152 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 FCGR3AP08637 254 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ZNF17P17021 662 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 NXPH1P58417 271 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 GRB2P62993 217 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 RTP5Q14D33 572 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 CST9LP1Q5W188 147 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 VHLLQ6RSH7 139 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OPN5Q6U736 354 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 SPNS3Q6ZMD2 512 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DPPA2Q7Z7J5 298 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OR2C3Q8N628 320 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 OR10V1Q8NGI7 309 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 EDAQ92838 391 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 DEFB127Q9H1M4 99 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 PRDM6Q9NQX0 595 aa7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 C19orf25Q9UFG5 118 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
SNX13-201ENST00000409076 A0A087WZY1 265 aa7.22□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.5 ms