RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296642.4

PGGT1B-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene PGGT1B, Length 552 nt, Biotype processed transcript.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-201ENST00000296642 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NUFIP1Q9UHK0 495 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MRM2Q9UI43 246 aaKnown RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF580Q9UK33 172 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ERGIC3Q9Y282 383 aa6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GYY5 206 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM172BPA6NC97 362 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TRIM64CA6NLI5 447 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 LOC110117498-PIK3R3F6TDL0 507 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 LINC01619G3V211 115 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 H3BN98 237 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 J3QR06 171 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TNFRSF11BO00300 401 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NME4O00746 187 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 LY6G6CO95867 125 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGN1P05114 100 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ARSBP15848 533 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IL3RAP26951 378 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MNAT1P51948 309 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP1B3P54709 279 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF91Q05481 1191 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF146Q15072 292 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 BCL2L15Q5TBC7 163 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TMEM42Q69YG0 159 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HACD2Q6Y1H2 254 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SLC25A26Q70HW3 274 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MOB3BQ86TA1 216 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ANGPTL5Q86XS5 388 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ANKRD13BQ86YJ7 626 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF679Q8IYX0 411 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM58AQ8N1B3 248 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CHST4Q8NCG5 386 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OR52N4Q8NGI2 321 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SLAMF9Q96A28 289 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FLYWCH2Q96CP2 140 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 NSMCE2Q96MF7 247 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TEAD3Q99594 435 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 YIPF3Q9GZM5 350 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GORASP2Q9H8Y8 452 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RHOFQ9HBH0 211 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SPAG4Q9NPE6 437 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SAR1AQ9NR31 198 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 FAM206AQ9NX38 181 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 STUB1Q9UNE7 303 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GYQ6 96 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 DSCAML1Q8TD84 2053 aa6.13□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ODAMA1E959 279 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 H0Y980 276 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 TXNL1O43396 289 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SELENOFO60613 162 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MMP23AO75900 390 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IGF1P05019 195 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CSN2P05814 226 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF44P15621 663 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 PRKACAP17612 351 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ALOX5APP20292 161 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 PSMB8P28062 276 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CD40LGP29965 261 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GLIPR1P48060 266 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RBP2P50120 134 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HMGA2P52926 109 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 EBI3Q14213 229 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 KRBOX4Q5JUW0 171 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IZUMO1Q8IYV9 350 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 AQP11Q8NBQ7 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OR10A7Q8NGE5 316 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OR9Q2Q8NGE9 314 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 DCUN1D4Q92564 292 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 RBMXL1Q96E39 390 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 KCTD7Q96MP8 289 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CADM1Q9BY67 442 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ARMC1Q9NVT9 282 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 C19orf73Q9NVV2 129 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MTCH1Q9NZJ7 389 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SNX5Q9Y5X3 404 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 U3KQV3 271 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 V9GYS6 101 aa6.12□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 KBTBD11-OT1A0A1B0GTJ5 212 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 A0A1W2PPI3 338 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SIRPB1O00241 398 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 HSD17B6O14756 317 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CCDC22O60826 627 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 INMTO95050 263 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 SOX14O95416 240 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 MOSP00540 346 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GASTP01350 101 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 IGLV3-1P01715 115 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 CD1BP29016 333 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 OR3A1P47881 315 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ROM1Q03395 351 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 AESQ08117 197 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 ZNF816Q0VGE8 651 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 APOFQ13790 326 aa6.11□□□□□ -1.43
PGGT1B-201ENST00000296642 GK3PQ14409 553 aa6.11□□□□□ -1.43
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