RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000295718.6

PTPRN-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type N, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRN, Length 3,784 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRN-201ENST00000295718 SLC25A22Q9H936 323 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 WFDC1Q9HC57 220 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MSL2Q9HCI7 577 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 POMT1Q9Y6A1 747 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 DOCK11Q5JSL3 2073 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR5H1A6NKK0 313 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CLDN34H7C241 214 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MELTFP08582 738 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 DANCRP0C864 163 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CARD18P57730 90 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 H3F3AP84243 136 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PLP2Q04941 152 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 NCR3LG1Q68D85 454 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FAM185AQ8N0U4 392 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-CQ95604 372 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FER1L5A0AVI2 2057 aa12.62□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 IGHV1OR21-1A0A087WYE8 117 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PPYP01298 95 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 IGKV3-11P04433 115 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 RPL29P47914 159 aaKnown RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SPATA46Q5T0L3 261 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FSCN3Q9NQT6 498 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZDHHC8Q9ULC8 765 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF814B7Z6K7 855 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LDLRAD4O15165 306 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FOSL1P15407 271 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PMS2P11Q13670 270 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FNDC7Q5VTL7 733 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF385CQ66K41 422 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM252Q8N6L7 170 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ERRFI1Q9UJM3 462 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 XKRY2A2RUG3 117 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MPPED1O15442 326 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HOXC4P09017 264 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LINC00271P0C7V0 271 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TRGC1P0CF51 173 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 HLA-GP17693 338 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GDF1P27539 372 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MSX1P28360 303 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM41BQ5BJD5 291 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CCDC54Q8NEL0 328 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MYOTQ9UBF9 498 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TMED3Q9Y3Q3 217 aa12.61□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CLN3Q13286 438 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 WDFY1Q8IWB7 410 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ATG101Q9BSB4 218 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TMEM100Q9NV29 134 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FUT3P21217 361 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CD27P26842 260 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 IL13RA2Q14627 380 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LPAL2Q16609 132 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CDPF1Q6NVV7 123 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ADPRHL1Q8NDY3 354 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR13D1Q8NGV5 346 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TP53RKQ96S44 253 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PSENENQ9NZ42 101 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PLXNA2O75051 1894 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 C5orf49A4QMS7 147 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CRYM-AS1A6NIL9 109 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 C3orf80F5H4A9 247 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 KRASP01116 189 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CD5P06127 495 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 GALNSP34059 522 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PYY3Q5JQD4 70 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 Q8WTZ3 238 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 NINJ1Q92982 152 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MVB12AQ96EY5 273 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SAMD10Q9BYL1 202 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CACNG5Q9UF02 275 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LRRK1Q38SD2 2015 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PCNX3Q9H6A9 2034 aa12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 KIF26AQ9ULI4 1882 aaPredicted RBP12.6□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PQD3 144 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LMO7DNF2Z398 122 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SIRPB1O00241 398 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PLGLB1Q02325 96 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ANKRD37Q7Z713 158 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 OR10J5Q8NHC4 309 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 ZNF488Q96MN9 340 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 DOCK10Q96BY6 2186 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SPINK4O60575 86 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SHDQ96IW2 340 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1B0GTQ1 180 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 A0A1W2PNV4 684 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 LILRA5A6NI73 299 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 UBE2CO00762 179 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 MRPL33O75394 65 aaKnown RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 DFFBO76075 338 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 SRPXP78539 464 aa12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 IGLV3-21P80748 117 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
PTPRN-201ENST00000295718 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP12.59□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 74.4 ms