RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000249504.6

HOXD11-201, Transcript of homeobox D11, humanhuman

APPRIS P1 TSL 3 BASIC

Gene HOXD11, Length 1,533 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11-201ENST00000249504 TAF9Q16594 264 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM249Q2WGJ8 235 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM89BQ8N5H3 189 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 OR5T2Q8NGG2 359 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ANGPTL6Q8NI99 470 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TMEM246Q9BRR3 403 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NICN1Q9BSH3 213 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF665Q9H7R5 613 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF222Q9UK12 451 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 A0A0A6YYD4 124 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 A0A1W2PQ09 198 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A10PA6NDY2 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A18PA6NE21 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A16PA6NEW6 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A20PA6NIJ5 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A8PA6NJQ4 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A7PA6NKC0 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 RFPL4AA6NLU0 287 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A22PA8MWA6 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A12PA8MX19 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A5PA8MXJ8 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A23PA8MXZ1 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TNFRSF13BO14836 293 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GSTZ1O43708 216 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 HAND1O96004 215 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV2-5P01817 119 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 HLA-DQB1P01920 261 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A15PP0C7V4 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A13PP0C7W8 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A14PP0C7W9 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FAM90A24PP0C7X0 464 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IL2RGP31785 369 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TAS2R20P59543 309 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 MPV17LQ2QL34 196 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 Q6P435 159 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IZUMO1Q8IYV9 350 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 POC5Q8NA72 575 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CHPT1Q8WUD6 406 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 THAP7Q9BT49 309 aaPredicted RBP16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 OR14J1Q9UGF5 321 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GLS2Q9UI32 602 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA1O95477 2261 aa16.24■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CEACAM18A8MTB9 384 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 SH2D1BO14796 132 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GYPAP02724 150 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 RPS2P15880 293 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 AMY2BP19961 511 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GABRR1P24046 479 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 PRDX2P32119 198 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GZMKP49863 264 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 LMO4P61968 165 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TRIM16LQ309B1 348 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ATPAF1Q5TC12 328 aaPredicted RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 DCDC5Q6ZRR9 648 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CD177Q8N6Q3 437 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 DNTTIP1Q9H147 329 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IFT22Q9H7X7 185 aa16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 PATZ1Q9HBE1 687 aaKnown RBP16.23■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FOXI3A8MTJ6 420 aaPredicted RBP16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NDUFA2O43678 99 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TFF1P04155 84 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IKZF1Q13422 519 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 PDCD1Q15116 288 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF788Q6ZQV5 615 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 OR56B1Q8NGI3 324 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 SMIM4Q8WVI0 70 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF581Q9P0T4 197 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 MIOXQ9UGB7 285 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 HIVEP1P15822 2718 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 DOCK11Q5JSL3 2073 aa16.22■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ABCA2Q9BZC7 2435 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GABARAPH6UMI1 98 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 RAB27BO00194 218 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 DEGS1O15121 323 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 OR7C1O76099 320 aaPredicted RBP16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 OR2H2O95918 312 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 PTTG1O95997 202 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CHRM2P08172 466 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 IGHV4-31P0DP07 118 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 LMO1P25800 156 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 GABRA2P47869 451 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 VEGFCP49767 419 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 ASAH1Q13510 395 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 SIGIRRQ6IA17 410 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 NLRC3Q7RTR2 1065 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 FCAMRQ8WWV6 532 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 SDSLQ96GA7 329 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 CSPG4Q6UVK1 2322 aa16.21■□□□□ 0.19
HOXD11-201ENST00000249504 TRAV18A0A075B6X5 111 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD11-201ENST00000249504 SOCS1O15524 211 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD11-201ENST00000249504 ZNF44P15621 663 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD11-201ENST00000249504 COL10A1Q03692 680 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD11-201ENST00000249504 OXA1LQ15070 435 aa16.2■□□□□ 0.18
HOXD11-201ENST00000249504 MOGAT2Q3SYC2 334 aa16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms