RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000602290.1

HCG18-241, Transcript of HLA complex group 18, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HCG18, Length 821 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCG18-241ENST00000602290 SMIM30A4D0T7 59 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SEC14L6B5MCN3 397 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GPR137BO60478 399 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ARL6IP5O75915 188 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PMS2P2O95744 297 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CSNK2A1P68400 391 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MADCAM1Q13477 382 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RAB12Q6IQ22 244 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 HIST2H3AQ71DI3 136 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 COMTD1Q86VU5 262 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 COMMD1Q8N668 190 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR6N1Q8NGY5 312 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GPR119Q8TDV5 335 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SPRYD4Q8WW59 207 aaPredicted RBP9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF426Q9BUY5 554 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 A4GALTQ9NPC4 353 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RCE1Q9Y256 329 aa9.75□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GTI1 187 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RBMY1BA6NDE4 496 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RBMY1EA6NEQ0 496 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 J3KTA2 159 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FFAR1O14842 300 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TGOLN2O43493 480 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MT-ND5P03915 603 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 F13BP05160 661 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RBMY1DP0C7P1 496 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RAB5AP20339 215 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 GABRA3P34903 492 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR1E2P47887 323 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PPT1P50897 306 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 P2RX1P51575 399 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CAV2P51636 162 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 H2BFSP57053 126 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 UBE2NP61088 152 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RAP1AP62834 184 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TRA2BP62995 288 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 HERPUD1Q15011 391 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SAPCD1Q5SSQ6 148 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 EIF5AL1Q6IS14 154 aaKnown RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 REEP3Q6NUK4 255 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF613Q6PF04 617 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LINGO2Q7L985 606 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 DPPA2Q7Z7J5 298 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF383Q8NA42 475 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZNF511Q8NB15 262 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR2G2Q8NGZ5 317 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NFKBIDQ8NI38 313 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 BBS10Q8TAM1 723 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ST7LQ8TDW4 575 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CFHR4Q92496 578 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ZDHHC16Q969W1 377 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TMEM45BQ96B21 275 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 APIPQ96GX9 242 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FRG2BQ96QU4 278 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 VSX1Q9NZR4 365 aaPredicted RBP9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 FLVCR2Q9UPI3 526 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SLC35A3Q9Y2D2 325 aa9.74□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 A0A087X0M5 115 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 IGHV1-69-2A0A0G2JMI3 117 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 A0A1B0GX30 115 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SULT2B1O00204 365 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 DNPH1O43598 174 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NKX2-2O95096 273 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 MBP02144 154 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CD74P04233 296 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CD5P06127 495 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CALCBP10092 127 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 LAMP1P11279 417 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TPT1P13693 172 aaKnown RBP9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ETFAP13804 333 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CBR1P16152 277 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CD80P33681 288 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 H3F3AP84243 136 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PAX2Q02962 417 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 EGR3Q06889 387 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RHEBQ15382 184 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 DEFB121Q5J5C9 76 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 PYY3Q5JQD4 70 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 AWAT2Q6E213 333 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR10K2Q6IF99 312 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 NHLRC1Q6VVB1 395 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 CLECL1Q8IZS7 167 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ACBD7Q8N6N7 88 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 OR56B1Q8NGI3 324 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ABHD4Q8TB40 342 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 SYT4Q9H2B2 425 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 RERGLQ9H628 205 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 TREM1Q9NP99 234 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 UBQLN4Q9NRR5 601 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 AHSPQ9NZD4 102 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 COMMD9Q9P000 198 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 VPS29Q9UBQ0 182 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ETV7Q9Y603 341 aa9.73□□□□□ -0.85
HCG18-241ENST00000602290 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.73□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 45.9 ms