RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580170.5

PTPRM-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRM, Length 5,941 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-211ENST00000580170 TMEM147Q9BVK8 224 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 FLRT3Q9NZU0 649 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 DYNLT3P51808 116 aa18.9■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 DRD3P35462 400 aa18.89■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 PNRC1Q12796 327 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 LRRC29Q8WV35 223 aa18.89■□□□□ 0.62
PTPRM-211ENST00000580170 MIXL1Q9H2W2 232 aa18.89■□□□□ 0.62
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PTPRM-211ENST00000580170 PWWP2BQ6NUJ5 590 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 OR4F17Q8NGA8 305 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF552Q9H707 407 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 OR2T10Q8NGZ9 312 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 NEIL1Q96FI4 390 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CDRT15L2A8MXV6 281 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 SLC26A10Q8NG04 563 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 C7orf77A4D0Y5 90 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CTSDP07339 412 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 PRSS12P56730 875 aa18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 FAHD2BQ6P2I3 314 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 FAHD2AQ96GK7 314 aa18.89■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 ETV3LQ6ZN32 361 aa18.88■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 MRGPRDQ8TDS7 321 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 M0R2Z0 102 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CLEC18BQ6UXF7 455 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 OR6X1Q8NH79 312 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 ZFP64Q9NPA5 681 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 TRAV17A0A0B4J275 112 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 M0QZ24 198 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CD160O95971 181 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 NPEPL1Q8NDH3 523 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 RPS4Y2Q8TD47 263 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 NAT8Q9UHE5 227 aa18.88■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 TTC3P53804 2025 aa18.88■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 RNF24Q9Y225 148 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 DOCK1Q14185 1865 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CTGFP29279 349 aa18.87■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 RPS4XP62701 263 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 ZNF764Q96H86 408 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
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PTPRM-211ENST00000580170 IGF2P01344 180 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 STARD4Q96DR4 205 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CXXC4Q9H2H0 198 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 LYPD8Q6UX82 237 aa18.85■□□□□ 0.61
PTPRM-211ENST00000580170 OR5D13Q8NGL4 314 aa18.85■□□□□ 0.61
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