RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578916.2

PTPRM-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRM, Length 604 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-210ENST00000578916 SMAD5-AS1Q9Y6J3 95 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 STARD9Q9P2P6 4700 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SERPINE3A8MV23 424 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LEUTXA8MZ59 168 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SEC14L6B5MCN3 397 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LY86O95711 162 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FABP3P05413 133 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CAMLGP49069 296 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PRRX1P54821 245 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LCN1P1Q5VSP4 162 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TCF23Q7RTU1 214 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SBSPONQ8IVN8 264 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ABHD12Q8N2K0 398 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 COMMD1Q8N668 190 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR2T33Q8NG76 320 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR4Q3Q8NH05 313 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OTOSQ8NHW6 89 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF596Q8TC21 504 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RAX2Q96IS3 184 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NOL4LQ96MY1 436 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZMAT4Q9H898 229 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MED20Q9H944 212 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 EFCAB1Q9HAE3 211 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PAIP2BQ9ULR5 123 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 AKAP8LQ9ULX6 646 aaKnown RBP eCLIP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HHLA2Q9UM44 414 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PIGLQ9Y2B2 252 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF256Q9Y2P7 627 aaPredicted RBP7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MOB4Q9Y3A3 225 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00312Q9Y6C7 94 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HYDINQ4G0P3 5121 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 A0A0U1RQV5 110 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM183AA6NL82 134 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF737O75373 536 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GASTP01350 101 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SEMG1P04279 462 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 FAM106CPP0CH98 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 COX4I1P13073 169 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ARL3P36405 182 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CEACAM3P40198 252 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MNDAP41218 407 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 BDH1Q02338 343 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR52W1Q6IF63 320 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 C8orf82Q6P1X6 216 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ASRGL1Q7L266 308 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TRPM8Q7Z2W7 1104 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 RTN4RL2Q86UN3 420 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 STX12Q86Y82 276 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR9Q2Q8NGE9 314 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR8U1Q8NH10 309 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR51E1Q8TCB6 317 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CREB3L1Q96BA8 519 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SNX22Q96L94 193 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 OR51V1Q9H2C8 321 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 IL1RAPQ9NPH3 570 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GPR84Q9NQS5 396 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CMC2Q9NRP2 79 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GPR173Q9NS66 373 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SCOCQ9UIL1 159 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LINC00527Q9UJ94 153 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM269A0A1B0GVZ9 245 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TMEM82A0PJX8 343 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PQLC2LA1A4F0 135 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ARRDC5A6NEK1 342 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TNFRSF11BO00300 401 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TOR1AO14656 332 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SELENOFO60613 162 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MMP23AO75900 390 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 KRT36O76013 467 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SCAF4O95104 1147 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SOX14O95416 240 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GABRR1P24046 479 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CBX5P45973 191 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ERVK11-1P61568 191 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ESRRGP62508 458 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 GRK1Q15835 563 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ZNF260Q3ZCT1 412 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CLVS2Q5SYC1 327 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TPTE2P1Q5T6R2 138 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 PRAMEF5Q5TYX0 476 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 SLX4IPQ5VYV7 408 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CCDC144NLQ6NUI1 221 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 BAIAP2L2Q6UXY1 529 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HACD2Q6Y1H2 254 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 LCNL1Q6ZST4 164 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 HDXQ7Z353 690 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 ANGPTL5Q86XS5 388 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TRMT10AQ8TBZ6 339 aaKnown RBP7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 MUL1Q969V5 352 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 TEAD3Q99594 435 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 BTBD10Q9BSF8 475 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 CHST6Q9GZX3 395 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRM-210ENST00000578916 DCLRE1BQ9H816 532 aa7.18□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 182.5 ms