RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555904.1

ABCD4-223, Transcript of ATP binding cassette subfamily D member 4, human

TSL 3

Gene ABCD4, Length 582 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ABCD4-223	ENST00000555904	FOXB2	Q5VYV0	432 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB12	Q6IQ22	244 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF788	Q6ZQV5	615 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CLDND2	Q8NHS1	167 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MCFD2	Q8NI22	146 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NEK7	Q8TDX7	302 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SDSL	Q96GA7	329 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NEDD4L	Q96PU5	975 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TM2D1	Q9BX74	207 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	C6orf62	Q9GZU0	229 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SEBOX	Q9HB31	216 aa	Predicted RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PATZ1	Q9HBE1	687 aa	Known RBP	10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CLN8	Q9UBY8	286 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ADAM30	Q9UKF2	790 aa		10.45	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV4-61	A0A0C4DH41	118 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MCRIP1	C9JLW8	97 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RNF223	E7ERA6	249 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	HSPB6	O14558	160 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TALDO1	P37837	337 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	VEGFC	P49767	419 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NPY4R	P50391	375 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GNB2	P62879	340 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RBM39	Q14498	530 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LYPD2	Q6UXB3	125 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GDPD3	Q7L5L3	318 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CD177	Q8N6Q3	437 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNRF1	Q8ND25	227 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	WFDC11	Q8NEX6	87 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5D13	Q8NGL4	314 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB40A	Q8WXH6	277 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	S100A16	Q96FQ6	103 aa	Known RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GAFA1	Q96PS6	74 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	REG4	Q9BYZ8	158 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LPAR5	Q9H1C0	372 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	IFT22	Q9H7X7	185 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DIABLO	Q9NR28	239 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A10	Q9UBX3	287 aa	Predicted RBP	10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ZNF222	Q9UK12	451 aa		10.44	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	USF3	Q68DE3	2245 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	POLQ	O75417	2590 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FUOM	A2VDF0	154 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM25A	B3EWG3	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM25C	B3EWG5	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM25G	B3EWG6	89 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC33A1	O00400	549 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DVL1	O14640	695 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GPR37	O15354	613 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PDCD6	O75340	191 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	IGHV2-5	P01817	119 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	APOA1	P02647	267 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TK1	P04183	234 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NDUFB7	P17568	137 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FUT3	P21217	361 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	BLVRB	P30043	206 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	S100A5	P33763	92 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	KCNJ3	P48549	501 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	EFNB2	P52799	333 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MRPS15	P82914	257 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LOXL1	Q08397	574 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ARL6IP1	Q15041	203 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PDCD1	Q15116	288 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	GRK1	Q15835	563 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR8H2	Q8N162	312 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR5H6	Q8NGV6	325 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ST8SIA4	Q92187	359 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	RAB3C	Q96E17	227 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SNX22	Q96L94	193 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CMTM3	Q96MX0	182 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	NICN1	Q9BSH3	213 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	DPCD	Q9BVM2	203 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SSBP3	Q9BWW4	388 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SLIRP	Q9GZT3	109 aa	Known RBP	10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PLEKHJ1	Q9NW61	149 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PEX16	Q9Y5Y5	336 aa		10.43	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SPG11	Q96JI7	2443 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A075B6Q4	140 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A0A0A6YYH2	397 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		A6NJ64	397 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		K7N7A8	449 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	MGST3	O14880	152 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	HPGDS	O60760	199 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	TFF1	P04155	84 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	WNT2	P09544	360 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	LMO1	P25800	156 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CD276	Q5ZPR3	534 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904		Q6P435	159 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	FAM89B	Q8N5H3	189 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SUMF2	Q8NBJ7	301 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	OR10R2	Q8NGX6	335 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	SLC25A38	Q96DW6	304 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	CHST6	Q9GZX3	395 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	ABCG5	Q9H222	651 aa		10.42	□□□□□ -0.74
ABCD4-223	ENST00000555904	PPA2	Q9H2U2	334 aa		10.42	□□□□□ -0.74

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