RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000529998.5

UBASH3B-205, Transcript of ubiquitin associated and SH3 domain containing B, humanhuman

TSL 4

Gene UBASH3B, Length 698 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3B-205ENST00000529998 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR2H2O95918 312 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 EPHA1P21709 976 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GABRR1P24046 479 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 LMO1P25800 156 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GABRA5P31644 462 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 MTNR1BP49286 362 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 DLX1P56177 255 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PRB3Q04118 309 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TRAM1Q15629 374 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 KCTD21Q4G0X4 260 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 HSD17B12Q53GQ0 312 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 METTL11BQ5VVY1 283 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TMEM200BQ69YZ2 307 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GLIPR1L1Q6UWM5 242 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CDH26Q8IXH8 852 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 FAM185AQ8N0U4 392 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 BCL6BQ8N143 479 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR8H2Q8N162 312 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TEX29Q8N6K0 151 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR4S1Q8NGB4 309 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR4D6Q8NGJ1 314 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR51T1Q8NGJ9 327 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 C22orf15Q8WYQ4 148 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PHYHIPQ92561 330 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SNX22Q96L94 193 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 DMRTB1Q96MA1 342 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 C1orf147Q96MC9 270 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GFI1Q99684 422 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 METTL9Q9H1A3 318 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TCF7L1Q9HCS4 588 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 NDUFB11Q9NX14 153 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 IL36GQ9NZH8 169 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF581Q9P0T4 197 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ONECUT1Q9UBC0 465 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF69Q9UC07 566 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GLS2Q9UI32 602 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 NUP50Q9UKX7 468 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 MRPS28Q9Y2Q9 187 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 KPTNQ9Y664 436 aa7.14□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TRBV23-1A0A0A0MS06 115 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TRAV40A0A0B4J280 105 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CENPVL3A0A0U1RRI6 287 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 MEGF11A6BM72 1044 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC33A1O00400 549 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 DEGS1O15121 323 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 IFNA2P01563 188 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CD37P11049 281 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF44P15621 663 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SERPINA2P20848 420 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PSMA1P25786 263 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PSMB9P28065 219 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR3A1P47881 315 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 BMXP51813 675 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ERVFRD-1P60508 538 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 RPL31P62899 125 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SRSF2Q01130 221 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 EDDM3AQ14507 147 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF273Q14593 569 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GRK1Q15835 563 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PIGYQ3MUY2 71 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SLC22A6Q4U2R8 563 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 BRD3OSQ6XYD6 125 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GDPD3Q7L5L3 318 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 VMO1Q7Z5L0 202 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PDZD9Q8IXQ8 264 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OSR2Q8N2R0 312 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 C11orf42Q8N5U0 333 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TPRX1Q8N7U7 411 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 NKAIN3Q8N8D7 197 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 OR5D13Q8NGL4 314 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 FCGR1BQ92637 280 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 LHX4Q969G2 390 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 S100A13Q99584 98 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 PPA2Q9H2U2 334 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SIRT7Q9NRC8 400 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ST3GAL6Q9Y274 331 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 KIAA2026Q5HYC2 2103 aa7.13□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TRAV24A0A0B4J272 114 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 SHISA3A0PJX4 238 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 M0R1W7 72 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CCRL2O00421 344 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 MGST3O14880 152 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 GEMIN2O14893 280 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 ARL6IP5O75915 188 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CSTBP04080 98 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CCL3L1P16619 93 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 CALRP27797 417 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 DLX6P56179 175 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 EDDM3BP56851 147 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 RBM11P57052 281 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 AESQ08117 197 aa7.12□□□□□ -1.27
UBASH3B-205ENST00000529998 IL13RA2Q14627 380 aa7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 30 ms