RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPZ6 126 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MARCH11A6NNE9 402 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ZNF716A6NP11 495 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 KCNAB3O43448 404 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CYTIPO60759 359 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CHRM2P08172 466 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MELTFP08582 738 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 C3AR1Q16581 482 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ADAM5Q6NVV9 412 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 C16orf54Q6UWD8 224 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 A0A1W2PPE3 182 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 ZNF205O95201 554 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 PDCD1Q15116 288 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SLC9A3R2Q15599 337 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ATP1A1-AS1Q5TC04 95 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 OR56B1Q8NGI3 324 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 REEP6Q96HR9 211 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 FOXB1Q99853 325 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HDHD3Q9BSH5 251 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PRDM14Q9GZV8 571 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 TMEM231Q9H6L2 316 aa6.07□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 LOC400499M0QZD8 3231 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PRR14LQ5THK1 2151 aa6.07□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 PTPRZ1P23471 2315 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 CCL2P13500 99 aa6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 OR1F12Q8NHA8 337 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 ITLN2Q8WWU7 325 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 TRAV14DV4A0A0A6YYC5 116 aa6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 NEURL1O76050 574 aa6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 CCDC54Q8NEL0 328 aa6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 OR5H2Q8NGV7 314 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 OR10J5Q8NHC4 309 aa6.06□□□□□ -1.44
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HERC4-211ENST00000492996 RFPL4AL1F8VTS6 287 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 MFNGO00587 321 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SYNGR3O43761 229 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 SCGNO76038 276 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 HPNP05981 417 aa6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 GSTP1P09211 210 aaKnown RBP6.06□□□□□ -1.44
HERC4-211ENST00000492996 CNR1P21554 472 aa6.06□□□□□ -1.44
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