RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489344.5

RBM3-208, Transcript of RNA binding motif protein 3, human

TSL 2

Gene RBM3, Length 724 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBM3-208	ENST00000489344	C11orf53	Q8IXP5	236 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344		Q8N7P7	452 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	LY6G5B	Q8NDX9	201 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	BEND2	Q8NDZ0	799 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	MGLL	Q99685	303 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	NKX3-1	Q99801	234 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CHST5	Q9GZS9	411 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	FGF23	Q9GZV9	251 aa	Predicted RBP	11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	KAAG1	Q9UBP8	84 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	SLC7A11	Q9UPY5	501 aa		11.23	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	hCG_1807616	A0A1W2PRN6	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OR5B21	A6NL26	309 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344		A6NLC8	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TNFAIP8	O95379	198 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CD2	P06729	351 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OCM2	P0CE71	109 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	ATF1	P18846	271 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	KRTAP10-11	P60412	298 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	RPS11	P62280	158 aa	Known RBP eCLIP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	COL10A1	Q03692	680 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	MLLT11	Q13015	90 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TPBG	Q13641	420 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	HABP2	Q14520	560 aa	Predicted RBP	11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF773	Q6PK81	442 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	UTS2B	Q765I0	119 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF367	Q7RTV3	350 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	MS4A15	Q8N5U1	240 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	PARP16	Q8N5Y8	322 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	GCSAM	Q8N6F7	178 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	WFDC9	Q8NEX5	89 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OR5D14	Q8NGL3	314 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OR13C5	Q8NGS8	318 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	C17orf50	Q8WW18	174 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	UFD1	Q92890	307 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TNFRSF14	Q92956	283 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CCL13	Q99616	98 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	B9D2	Q9BPU9	175 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	NPFFR1	Q9GZQ6	430 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	FAM234A	Q9H0X4	552 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	ZCCHC4	Q9H5U6	513 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	RAB18	Q9NP72	206 aa		11.22	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TRBV5-5	A0A0J9YX44	114 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	FAM230A	A0A1W2PPH8	454 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CDIPT	O14735	213 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CHST1	O43916	411 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CPE	P16870	476 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	PAX6	P26367	422 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	UBE2E1	P51965	193 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	FUT6	P51993	359 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CNN3	Q15417	329 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	LRRC75B	Q2VPJ9	315 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344		Q499Y3	187 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	LIPK	Q5VXJ0	399 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	CRIP3	Q6Q6R5	217 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	FAM216B	Q8N7L0	139 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TRMT10A	Q8TBZ6	339 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	RPL3L	Q92901	407 aa	Known RBP	11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TMEM106A	Q96A25	262 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OPALIN	Q96PE5	141 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	TLNRD1	Q9H1K6	362 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	OR51I2	Q9H344	312 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	BOLA1	Q9Y3E2	137 aa		11.21	□□□□□ -0.61
RBM3-208	ENST00000489344	IGKV1-9	A0A0C4DH69	117 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		A0A1W2PRX2	142 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PQLC2L	A1A4F0	135 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OCM	P0CE72	109 aa	Predicted RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	PRKACB	P22694	351 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	IKZF1	Q13422	519 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	UBE2U	Q5VVX9	321 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TEX36	Q5VZQ5	186 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	WDR82	Q6UXN9	313 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF573	Q86YE8	665 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DTX3	Q8N9I9	347 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	DNAAF1	Q8NEP3	725 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF671	Q8TAW3	534 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	H1FX	Q92522	213 aa	Known RBP	11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	FCGR1B	Q92637	280 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	BORCS8	Q96FH0	119 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TMED9	Q9BVK6	235 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ZNF702P	Q9H963	129 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SERTAD4	Q9NUC0	356 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SACS	Q9NZJ4	4579 aa		11.2	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344		A0A087WXM4	84 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MEGF11	A6BM72	1044 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	LHB	P01229	141 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	AZGP1	P25311	298 aa	Known RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	HAAO	P46952	286 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	RBP2	P50120	134 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	BMX	P51813	675 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ATP1B3	P54709	279 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	MICB	Q29980	383 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ACSM3	Q53FZ2	586 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	NCR3LG1	Q68D85	454 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	HAGHL	Q6PII5	290 aa	Predicted RBP	11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	UNQ9370/PRO34162	Q6UXP9	181 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	SLC36A1	Q7Z2H8	476 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	ANGPTL5	Q86XS5	388 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	TSPAN14	Q8NG11	270 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR13C9	Q8NGT0	318 aa		11.19	□□□□□ -0.62
RBM3-208	ENST00000489344	OR10Z1	Q8NGY1	313 aa		11.19	□□□□□ -0.62

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