RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, humanhuman

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRF-210ENST00000463041 UBE2J1Q9Y385 318 aaPredicted RBP5.9□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 MINOS1-NBL1R4GNA1 71 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRF-210ENST00000463041 A0A0G2JK05 382 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ODF3BA8MYP8 253 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MAGEB3O15480 346 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZFPL1O95159 310 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DYNLT3P51808 116 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 EFNB2P52799 333 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DEFA6Q01524 100 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 EDDM3AQ14507 147 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HERPUD1Q15011 391 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 KISS1Q15726 138 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 FAM189A2Q15884 450 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SSX2Q16385 188 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR52W1Q6IF63 320 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 Q6ZTK2 550 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RTN4RL2Q86UN3 420 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CHST4Q8NCG5 386 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF555Q8NEP9 628 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR4S1Q8NGB4 309 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR51A4Q8NGJ6 313 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR52I1Q8NGK6 324 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR10AC1Q8NH08 325 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CHST6Q9GZX3 395 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 COMMD4Q9H0A8 199 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM133Q9H2Q1 129 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ISG20L2Q9H9L3 353 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 AMBNQ9NP70 447 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ABCB10Q9NRK6 738 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TAS2R3Q9NYW6 316 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GSTK1Q9Y2Q3 226 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SESN1Q9Y6P5 492 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TRGV10A0A0A0MS01 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IGHV2-26A0A0B4J1V2 119 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1-12A0A0C4DH73 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IRGMA1A4Y4 181 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 A6NDX4 124 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 E9PI62 339 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DEGS1O15121 323 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 KCNAB3O43448 404 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SULT1B1O43704 296 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 BAG2O95816 211 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR2H2O95918 312 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IGKV1D-12P01611 117 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ALDOBP05062 364 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CSN2P05814 226 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HCKP08631 526 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CSF1P09603 554 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMEM225BP0DP42 221 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CALCBP10092 127 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PAX6P26367 422 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DCKP27707 260 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HTR1DP28221 377 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR3A1P47881 315 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MTNR1BP49286 362 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RAB13P51153 203 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 P2RX3P56373 397 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SCN1BQ07699 218 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IL18R1Q13478 541 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 C2orf68Q2NKX9 166 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CCDC58Q4VC31 144 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 LDLRAD2Q5SZI1 272 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TTC23Q5W5X9 447 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ELP2Q6IA86 826 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 Q6P435 159 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RPL22L1Q6P5R6 122 aaKnown RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 HEPN1Q6WQI6 88 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TMPRSS11AQ6ZMR5 421 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TCF23Q7RTU1 214 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TRAPPC6BQ86SZ2 158 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DYNAPQ8N1N2 210 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 Q8N2B8 174 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ABHD12Q8N2K0 398 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TPRX1Q8N7U7 411 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 Q8NFD4 153 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PXT1Q8NFP0 134 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 OR13C9Q8NGT0 318 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 ZNF596Q8TC21 504 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CFHR4Q92496 578 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 RFT1Q96AA3 541 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CREB3L1Q96BA8 519 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CPNE2Q96FN4 548 aaPredicted RBP5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 SPACA5Q96QH8 159 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 JAM3Q9BX67 310 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 CLEC7AQ9BXN2 247 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 PRSS22Q9GZN4 317 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 GAL3ST2Q9H3Q3 398 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 NCOR1P1Q9H4R4 102 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 C8orf4Q9NR00 106 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DPM3Q9P2X0 92 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 IL36RNQ9UBH0 155 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 DHDHQ9UQ10 334 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 TCF19Q9Y242 345 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 MEX3AA1L020 520 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
PTPRF-210ENST00000463041 FAM90A22PA8MWA6 464 aa5.87□□□□□ -1.47
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