RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442481.5

PRAME-210, Transcript of preferentially expressed antigen in melanoma, humanhuman

TSL 3

Gene PRAME, Length 581 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAME-210ENST00000442481 NCS1P62166 190 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 RPS11P62280 158 aaKnown RBP eCLIP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ACSM3Q53FZ2 586 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 FOXB2Q5VYV0 432 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 C22orf42Q6IC83 251 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 Q6ZSV7 163 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 SLC36A1Q7Z2H8 476 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 CEACAM19Q7Z692 300 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ZNF573Q86YE8 665 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 OR13C3Q8NGS6 347 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 OR10Z1Q8NGY1 313 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ZNF671Q8TAW3 534 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 GPR148Q8TDV2 347 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 RAB2BQ8WUD1 216 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 AQP3Q92482 292 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 H1FXQ92522 213 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ITFG2Q969R8 447 aa9.59□□□□□ -0.87
PRAME-210ENST00000442481 ISOC1Q96CN7 298 aa9.59□□□□□ -0.87
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PRAME-210ENST00000442481 TRBV5-5A0A0J9YX44 114 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 A0A1W2PPK0 400 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 PQLC2LA1A4F0 135 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DHRS7CA6NNS2 312 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ANKHD1-EIF4EBP3H7C0V5 636 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 J3QT63 122 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 SELLP14151 372 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 Q499Y3 187 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 TMEM42Q69YG0 159 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CD200R1LQ6Q8B3 271 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 METAP1DQ6UB28 335 aaPredicted RBP9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TMEM91Q6ZNR0 172 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 BTN2A1Q7KYR7 527 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ANGPTL5Q86XS5 388 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 CCDC54Q8NEL0 328 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FGGYQ96C11 551 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 C12orf43Q96C57 262 aaKnown RBP9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 FAM192AQ9GZU8 254 aa9.58□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CNTD2Q9H8S5 307 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 POLDIP2Q9Y2S7 368 aa9.58□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 H3BMQ9 156 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NXPH2O95156 264 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CD2P06729 351 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 NDUFB7P17568 137 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 GALP22466 123 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MAPK3P27361 379 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FGF9P31371 208 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 CNN3Q15417 329 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 UBE2V2Q15819 145 aa9.57□□□□□ -0.88
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PRAME-210ENST00000442481 LRRC10Q5BKY1 277 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FAM76BQ5HYJ3 339 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 KPRPQ5T749 579 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 STUMQ69YW2 141 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 TMEM185AQ8NFB2 350 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ORAI1Q96D31 301 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ADAT3Q96EY9 351 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 DERL3Q96Q80 235 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CHST5Q9GZS9 411 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FAM234AQ9H0X4 552 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RAB18Q9NP72 206 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 EXOSC5Q9NQT4 235 aaKnown RBP eCLIP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ZNRD1Q9P1U0 126 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 ONECUT1Q9UBC0 465 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 KAAG1Q9UBP8 84 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FBLN5Q9UBX5 448 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 OR14J1Q9UGF5 321 aa9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RPUSD1Q9UJJ7 312 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 RNASEK-C17orf49H0YIS7 233 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SC5DO75845 299 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 MYL9P24844 172 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CALRP27797 417 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 SPCS2Q15005 226 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 FAM189A2Q15884 450 aa9.56□□□□□ -0.88
PRAME-210ENST00000442481 BEAN1Q3B7T3 259 aa9.56□□□□□ -0.88
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