RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000407997.3

APOBEC3G-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3G, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3G, Length 1,834 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPP1R1AQ13522 171 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB35Q15286 201 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RHEBQ15382 184 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 SGCAQ16586 387 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRRC37A5PQ49AS3 106 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CARD17Q5XLA6 110 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 BTNL8Q6UX41 500 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CATSPERDQ86XM0 798 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOLPP1Q86YN1 238 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 NKAIN3Q8N8D7 197 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 FAM57AQ8TBR7 257 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNRF4Q8WWF5 429 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ASB5Q8WWX0 329 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF385AQ96PM9 386 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 FOXB1Q99853 325 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 NUDT16L1Q9BRJ7 211 aaKnown RBP8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CENPMQ9NSP4 180 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM38BQ9NVV0 291 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CACFD1Q9UGQ2 172 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR52A1Q9UKL2 312 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 DHDHQ9UQ10 334 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 VSIG4Q9Y279 399 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRP12Q9Y561 859 aa8.66□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZGRF1Q86YA3 2104 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 SVILO95425 2214 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR6C6A6NF89 314 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 FIGNL2A6NMB9 653 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 J3QW42 95 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CCSO14618 274 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 LDLRAD4O15165 306 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLN5O75503 358 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RPP14O95059 124 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 F12P00748 615 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 IFNA10P01566 189 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ITGA5P08648 1049 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB5AP20339 215 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CPT2P23786 658 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 MAGEB1P43366 347 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 HTR5AP47898 357 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RIPPLY3P57055 190 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 HGFACQ04756 655 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR2B11Q5JQS5 317 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 C1orf174Q8IYL3 243 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 LYPD6BQ8NI32 183 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 ROBO4Q8WZ75 1007 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 SEC22AQ96IW7 307 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIRREL1Q96J84 757 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC6A7Q99884 636 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 CST11Q9H112 138 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFB127Q9H1M4 99 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB18Q9NP72 206 aa8.65□□□□□ -1.02
APOBEC3G-201ENST00000407997 A0A0U1RQV5 110 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 M0QYG6 137 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SS18L1O75177 396 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 IFNA17P01571 189 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 HTR2CP28335 458 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 GSK3AP49840 483 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 DEFA6Q01524 100 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PLP2Q04941 152 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SRYQ05066 204 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 FMODQ06828 376 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 LBHQ53QV2 105 aaPredicted RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 BIVMQ86UB2 503 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR10R2Q8NGX6 335 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 TSEN15Q8WW01 171 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 RAB3CQ96E17 227 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 TECTBQ96PL2 329 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CLCC1Q96S66 551 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SULT4A1Q9BR01 284 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SELENOIQ9C0D9 397 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRLF2Q9HC73 371 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 GPR35Q9HC97 309 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 LRBAP50851 2863 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 KIAA1549Q9HCM3 1950 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 IGHV3-15A0A0B4J1V0 119 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 MEIS3P1A6NDR6 274 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 CEACAM18A8MTB9 384 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PPIHO43447 177 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 TUBG1P23258 451 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PMPCAQ10713 525 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 ZNF585AQ6P3V2 769 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 DOK3Q7L591 496 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC16A14Q7RTX9 510 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 SLC22A24Q8N4F4 322 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR5D14Q8NGL3 314 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 AQP3Q92482 292 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 GTF3AQ92664 365 aaKnown RBP8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 BOD1Q96IK1 185 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 PFDN5Q99471 154 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 S100A13Q99584 98 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 RNF126Q9BV68 326 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 TOLLIPQ9H0E2 274 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 OR10A2Q9H208 303 aa8.64□□□□□ -1.03
APOBEC3G-201ENST00000407997 TMEM231Q9H6L2 316 aa8.64□□□□□ -1.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms