RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000342084.8

PTPRR-202, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type R, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene PTPRR, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRR-202ENST00000342084 SRYQ05066 204 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HABP2Q14520 560 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IL11RAQ14626 422 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CLINT1Q14677 625 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ARL6IP1Q15041 203 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 AWAT1Q58HT5 328 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PMS2CLQ68D20 193 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RTL6Q6ICC9 239 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF611Q8N823 705 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 CPEB3Q8NE35 698 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 DMBX1Q8NFW5 382 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NAT6Q93015 286 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SLAMF9Q96A28 289 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 C10orf35Q96D05 121 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MSI2Q96DH6 328 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 IP6K3Q96PC2 410 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 EIF5A2Q9GZV4 153 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FGF23Q9GZV9 251 aaPredicted RBP6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 MAGT1Q9H0U3 335 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 BCO1Q9HAY6 547 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF286AQ9HBT8 521 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 SPACA1Q9HBV2 294 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 RPS10P5Q9NQ39 176 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 HSF4Q9ULV5 492 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 KCNIP3Q9Y2W7 256 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 NSG2Q9Y328 171 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 FBXO7Q9Y3I1 522 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 PCSK5Q92824 1860 aa6.28□□□□□ -1.4
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPE3 182 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 A0A1W2PPH5 198 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 FAM24AA6NFZ4 105 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GPR137BO60478 399 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PDCD6O75340 191 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PRH1P02810 166 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GAPDHP04406 335 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 P04436 131 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 BCL3P20749 454 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ITGA3P26006 1051 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SNCAP37840 140 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 RBM11P57052 281 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 HERV-K104P61576 105 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 POLR2GP62487 172 aaKnown RBP eCLIP6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 MALLQ13021 153 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 TSC22D1Q15714 1073 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 LPAL2Q16609 132 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GUK1Q16774 197 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 TMEM42Q69YG0 159 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PPP1R32Q7Z5V6 425 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 UBAC2Q8NBM4 344 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 OR2V1Q8NHB1 315 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 FAM213BQ8TBF2 198 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 CPT1CQ8TCG5 803 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 INTS12Q96CB8 462 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 NTNG2Q96CW9 530 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GPR35Q9HC97 309 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 C19orf12Q9NSK7 152 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 COA4Q9NYJ1 87 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 STARD10Q9Y365 291 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 R4GN57 208 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 IGSF23A1L1A6 192 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 CDRT15L2A8MXV6 281 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 M0R036 132 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 HSD17B6O14756 317 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 TNFSF12O43508 249 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PPYP01298 95 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ARG1P05089 322 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 CELA3AP09093 270 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SCTP09683 121 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 OR13C7P0DN81 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF44P15621 663 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 TCN2P20062 427 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GDF1P27539 372 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SRD5A2P31213 254 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 HOXA1P49639 335 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 FUT6P51993 359 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SNRPEP62304 92 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SPIN3Q5JUX0 258 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ABLIM2Q6H8Q1 611 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SPINK14Q6IE38 97 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ASCL4Q6XD76 172 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 LGI3Q8N145 548 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 OR56B2PQ8NGI1 322 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 OR4D5Q8NGN0 318 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 EXTL1Q92935 676 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 MOB3AQ96BX8 217 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 GALNT14Q96FL9 552 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ADGRG7Q96K78 797 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 ZNF488Q96MN9 340 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SF3B5Q9BWJ5 86 aaKnown RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SCRT1Q9BWW7 348 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 HES7Q9BYE0 225 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PLEKHA2Q9HB19 425 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 BIN3Q9NQY0 253 aa6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 FAM212BQ9NTI7 297 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
PTPRR-202ENST00000342084 SLC7A11Q9UPY5 501 aa6.26□□□□□ -1.41
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