RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000027351.12

Ccl20-201, Transcript of C-C motif chemokine 20, mousemouse

TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccl20, Length 1,417 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lamp3Q7TST5 411 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ugt2a1Q80X89 528 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zik1Q80YP6 463 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ctdsp2Q8BX07 270 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 F930015N05RikQ8C3A3 210 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rft1Q8C3B8 541 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Faim2Q8K097 317 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Aimp2Q8R010 320 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem203Q8R235 136 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r8Q8R2C2 303 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmcc3Q8R310 477 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr825Q8VFU7 320 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1447Q8VFX3 309 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tssk6Q925K9 273 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GatbQ99JT1 557 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrpl41Q9CQN7 135 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rprd1bQ9CSU0 326 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Xrcc2Q9CX47 278 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmed5Q9CXE7 229 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4933428M09RikQ9D3X3 192 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lysmd2Q9D7V2 215 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vmn1r171Q9EPS6 316 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Slc13a2Q9ES88 586 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ntn4Q9JI33 628 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Klk1b27Q9JM71 263 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ch25hQ9Z0F5 298 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Chek2Q9Z265 546 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 FancmQ8BGE5 2021 aa6.36□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav6-7-dv9A0A075B639 125 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Trav12-2A0N8N6 114 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm13124A2A752 406 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ankrd60A2AMD2 318 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prr19B2RW88 366 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Zfp81B8JJZ7 531 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrr1D3YY91 422 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr178E9Q9T3 319 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr292F8VQ84 308 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mfsd4b4J3QNS5 503 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrpl23O35972 146 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Kcnj1O88335 372 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cryba1P02525 198 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bmi1P25916 324 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cdkn1bP46414 197 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Vgll3P85442 326 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 G6pd2P97324 513 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Sox14Q04892 240 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 XylbQ3TNA1 551 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr151Q60893 309 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gp49aQ61450 303 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Hist2h2abQ64522 130 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr988Q7TRA1 309 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr728Q7TRM6 311 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Psmf1Q8BHL8 271 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 E130116L18RikQ8BMV6 101 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gm5447Q8BPB2 115 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Znf786Q8BV42 777 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm4Q8C7Q4 361 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 9130230L23RikQ8CC80 163 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Thap1Q8CHW1 210 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tspan14Q8QZY6 270 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gabarapl1Q8R3R8 117 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rbm4bQ8VE92 357 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr1257Q8VGP0 309 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Olfr558Q8VGZ7 317 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pofut1Q91ZW2 393 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Parm1Q923D3 296 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Klk10Q99M20 278 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tprg1lQ9DBS2 266 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mettl15Q9DCL4 406 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ifi30Q9ESY9 248 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Ninj2Q9JL89 143 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pex14Q9R0A0 376 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Xcr1Q9R0M1 322 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Timm8a1Q9WVA2 97 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bcl10Q9Z0H7 233 aa6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Prpf8Q99PV0 2335 aaKnown RBP6.35□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Igkv14-100A0A0G2JG36 117 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Lrrc29A0A1B0GQY9 621 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 4930563M21RikA0A1L1SUT5 578 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 A0A286YCP9 139 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mrap2D3Z1Q2 207 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Calhm1D3Z291 348 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cpsf4lE9Q2N0 280 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nxph4G3X9N5 304 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 H3f3cP02301 136 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Krt1P04104 637 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Mpv17P19258 176 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cox4i1P19783 169 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Cdkn1aP39689 159 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Nsg2P47759 171 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Pcyt1aP49586 367 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 GifP52787 417 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Tmem165P52875 323 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rce1P57791 329 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Rasd2P63032 266 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Gcm1P70348 436 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Defb26Q30KN7 186 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Patl1Q3TC46 770 aaKnown RBP6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Elmod1Q3V1U8 326 aa6.34□□□□□ -1.39
Ccl20-201ENSMUST00000027351 Bbs1Q3V3N7 593 aa6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 35 ms